Corydoras microcephalus es una especie de pez del género Corydoras, de la familia Callichthyidae del orden Siluriformes.
Esta especie fue descrita originalmente en el año 1912 por el ictiólogo Charles Tate Regan.
[2] La localidad tipo es: La Plata, provincia de Buenos Aires, Argentina.
[7][8] La etimología de su denominación científica es la siguiente: Corydoras viene del griego,donde kóry es 'yelmo', 'coraza', 'casco', y doras es 'piel'.
Esto se justifica en la carencia de escamas y la presencia de escudos óseos a lo largo del cuerpo.