Es un patógeno aviar altamente infeccioso que afecta el tracto respiratorio, el intestino, el riñón y los sistemas reproductivos de los pollos.
A través de la viremia, algunas cepas nefrotrópicas (la mayoría de alta virulencia) podrían infectar el epitelio renal en los túbulos y la nefrona, causando insuficiencia renal.
La infección de los pollos en la pubertad, durante el desarrollo del oviducto, impedirá la formación del oviducto y destruirá la capacidad de colocación futura, dando como resultado "capas falsas".
Sin embargo, otras enfermedades que afectan a las gallinas ponedoras podrían provocar esa afección.
La naturaleza de la respuesta inmune protectora al coronavirus aviar es poco conocida, pero la proteína de la espiga superficial, la mitad S1 amino terminal, es suficiente para inducir una buena inmunidad protectora.