El báculo fue creciendo hasta convertirse en un gran árbol.[3] En 1543 le fue concedida a Felipe Martín la construcción de una capilla junto a la capilla mayor para su enterramiento y el de su familia.[4] Actual Hermandad de Confalón,[5] con sede en este convento.A comienzos del siglo XVIII el convento contaba con un centro de estudios y un noviciado.El número de religiosos que residían en este lugar iba entonces entre los treinta y los cincuenta.Las tropas llevaron a cabo la exclaustración del convento.[7] En 1821, durante el Trienio Liberal, el convento fue exclaustrado y los frailes se trasladaron al convento de Consolación de Utrera.[4] El edificio conventual, ya deshabitado, fue usado como casa de vecinos.[8] A mediados del siglo XX la iglesia se encontraba en ruinas.