Este organismo tenía autonomía e independencia económica, política y administrativa.

Para la llegada de Rafael Correa y la Asamblea Constituyente de 2008 una nueva constitución sería creada y otorgaría una nueva concepción de la estructura del estado ecuatoriano que cambia el concepto y contenido de los anteriores tres poderes tradicionales del estado y establece, en su lugar, cinco Funciones del Estado, las cuales son: La cuarta Función del Estado, según el orden constitucional, integra, fomenta e incentiva a la Participación Ciudadana.

[5]​ El 25 de marzo de 2010 en cumplimiento a las disposiciones constitucionales y a la Ley Orgánica de Participación, la elección se produjo tras una reunión del Pleno del Consejo que duró unos 40 minutos, siendo designados la socióloga Marcela Miranda Pérez y el abogado Fernando Cedeño como Presidenta y Vicepresidente del Consejo respectivamente.

[8]​[2]​ Los consejeros Rosero y Rivera que varias veces votaron en contra en las sesiones del pleno, siendo una minoría en el consejo.

Este no estuvo exento de críticas y acusaciones, las cuales incrementarían ante la posibles anomalías en su designación en un concurso realizado por el CNE que igualmente era criticado por los concursos del anterior pleno.

[17]​ Acusaciones similares son las realizadas por la Fundación Ciudadanía y Desarrollo (FCD) y Gustavo Jalkh en lo que incluye la crítica sobre la designación de autoridades de control transitorias, por esto no hallarse en sus funciones.

[21]​ Antes de terminar el período del Consejo transitorio, Julio César Trujillo fallece.

Su posesión se vio retrasada resultado de unas difíciles elecciones donde el exconsejero David Rosero señaló la promoción hecha por Rafael Correa de ciertos candidatos, acusación la cual no tendría efecto.

[22]​ Finalmente el 13 de junio de 2019 se dio la posesión del organismo e inmediatamente se indicó que había una división en dos grupos donde se formó una mayoría entre los consejeros Walter Gómez Ronquillo, José Tuárez, Rosa Chalá y Victoria Desintonio; y una minoría compuesta de Christian Cruz, María Fernanda Rivadeneira y Sofía Almeida.

[24]​ Tuárez a su vez se ha visto cuestionado por su hoja de vida que sería falsa, así como su supuesta desafiliación reciente del Partido Socialista Ecuatoriano.

[33]​ En noviembre de 2022, fueron enjuicicados políticamente Hernán Ulloa, María Fernanda Rivadeneira, Ibeth Estupiñan y Francisco Bravo.

[36]​ Tras este hecho, el Presidente de la Corte Nacional de Justicia envió cinco veces una terna para reemplazar a dicha vocal, sin que el CPCCS procese estas ternas.

[37]​ Tras esta destitución, se principalizaron los siguientes consejeros suplentes elegidos en 2019, quienes eligen como Presidenta a Gina Aguilar.

En septiembre, la Corte Constitucional convocó a una audiencia para verificar si esta convocatoria incumple el dictamen interpretativo que impide al CPCCS analizar las decisiones del CPCCS transitorio del período 2018-2019.

[40]​ En sustitución del destituido Alembert Vera, se principaliza el suplente Juan Esteban Guarderas.

Cabe recalcar que si bien fue removida como Presidenta, Nicole Bonifaz aún funge como consejera del CPCCS.