Las funciones del consejo son emitir decretos, aprobación de decisiones del presidente y de los proyectos ministeriales.

La sede del consejo es el Palacio de las Garzas.

En la Junta estaban también los ministros de Gobierno, Relaciones Exteriores, Instrucción Pública, Guerra y Marina, Justicia y Hacienda, aconsejando al triunvirato en sus edictos.

En 1904, cuando se promulgó la Constitución, Manuel Amador Guerrero fue designado presidente de la República por la Asamblea, donde dictaba que el poder ejecutivo se dividía en cuatro secretarías.

Los miembros actuales son los siguientes:[2]​ Asesor presidencial para temas financieros Asesor presidencial para temas económicos Asesor presidencial para temas marítimos y desarrollo logístico Asesor presidencial para temas constitucionales El viceministerio general en el Ministerio de la Presidencia ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Gobierno en el Ministerio de Gobierno ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Asuntos Indígenas en el Ministerio de Gobierno ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Política Exterior en el Ministerio de Relaciones Exteriores ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Asuntos Multilaterales y Cooperación en el Ministerio de Relaciones Exteriores ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Economía en el Ministerio de Economía y Finanzas ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministro de Finanzas en el Ministerio de Economía y Finanzas ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de Seguridad Pública ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Comercio Exterior en el Ministerio de Comercio e Industrias ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Comercio Interior en el Ministerio de Comercio e Industrias ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de Obras Públicas ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio académico en el Ministerio de Educación ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio administrativo en el Ministerio de Educación ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Infraestructura en el Ministerio de Educación ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de Salud ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de Trabajo y Desarrollo Laboral ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Vivienda en el Ministerio de Vivienda y Ordenamiento Territorial ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio de Ordenamiento Territorial en el Ministerio de Vivienda y Ordenamiento Territorial ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de Desarrollo Social ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de Desarrollo Agropecuario ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de Ambiente ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de Cultura ha sido ejercido por los siguientes individuos: El viceministerio general en el Ministerio de la Mujer ha sido ejercido por los siguientes individuos: