El equipo nació en 1963, como un club independiente fundado por la compañía eléctrica Endesa, ubicado en el barrio ponferradino de Compostilla, donde la empresa estatal inauguró su primera central térmica en España.
Ponferradina "B", con motivo del gasto en la remodelación de las instalaciones Vicente del Bosque, la Deportiva decidió rebajar otros gastos en lo relativo a la cantera, siempre dejando una puerta abierta a recuperar equipos o en su caso categorías.
Ponferradina "B", que había consumado el descenso a Regional de Aficionados.
El objetivo en la temporada del regreso del filial blanquiazul era quedar entre los tres primeros para ascender de categoría con resultado positivo, quedando segundos en la clasificación y ascendiendo a Primera División Provincial de León En la temporada 2013/2014 el club sufre una gran remodelación a nivel estructural, apostando firmemente por la cantera, contando con ilustres jugadores blaquiazules en la Dirección Técnica como Juan Fuentes y Rubén Vega y contando con el prometedor entrenador berciano Manolo Pérez.
Para esta temporada se ficha también a Ian (Morenica), Ruben (Norwich City) y Jaime (Astorga) además de otras 5 Altas.