[4]​ En fútbol el equipo disputó su primer campeonato nacional en 2012, cuando jugó el Torneo del Interior, donde llegó hasta la tercera fase, los dieciseisavos de final.

En la final cayó ante Unión de Goya, pero aun así logró el ascenso a la tercera división nacional.

[7]​ Tras 17 partidos jugados, donde el equipo ganó 6 encuentros, Jorge Caballero fue despedido de su cargo y asumió Fernando Rivero.

Tras ganar esa serie en tres de cinco partidos, se emparejó ante Villa Ángela Basket, el mejor equipo de la conferencia, que derrotó al equipo mercedino en una serie que se definió en el cuarto partido.

Para la segunda temporada Fernando Rivero continuó al mando del equipo.

Junto con la renovación contractual del entrenador llegaron algunos refuerzos al equipo que lo convirtieron en candidato, entre ellos estaba Nicolás Lauría que había sido elegido el mejor jugador del pasado TNA,[9]​ Ariel Pau y Gastón Torre.

Tras empatar en 78 y sin uno de sus mejores jugadores, el camerunés Gastón Essengué, Comunicaciones ganó 14 a 9 en los primeros cinco minutos adicionados.

En el marco preparatorio para dichas competencias disputó un amistoso ante San Martín de Corrientes, en el estadio del equipo rojinegro, donde ganó Comunicaciones 73 a 68.

[16]​ Luego comenzó la Liga Nacional, donde el equipo sufrió varias modificaciones de plantel a lo largo de la misma, llegó David Huertas a ocupar una plaza vacante, luego se fueron J.J.

El segundo encuentro lo ganó Comu en su cancha 89 a 68 y el tercer encuentro fue en cancha de Instituto, donde nuevamente ganó el equipo mercedeño (77 a 74) y avanzó de ronda.

En la temporada regular del torneo Comunicaciones logró una buena actuación y alcanzó 23 victorias en 38 partidos, lo que lo ubicó cuarto en la tabla general, clasificando a play-offs con ventaja de localía.

El partido definitivo lo ganó el equipo porteño 72 a 69 y así Comunicaciones alcanzó los cuartos de final en su segunda participación en Liga Nacional.

La nueva edición del torneo contó con un cuadrangular en cancha de Regatas Corrientes, donde además del local estuvo Comu y los equipos brasileros Pato Branco Basquete y Universo Brasília.