Clasificación para la Copa Africana de Naciones de 2013

Sudáfrica se clasificó automáticamente por su condición de local.

Inicialmente se piensa en que los clasificados a la edición anterior (2012) sean los mismos que en esta ya que no habría tiempo para hacer un nuevo proceso clasificatorio.

Un total de 47 países participaran en el certamen, incluyendo a Sudáfrica, que clasificó automáticamente por ser el anfitrión.

Los otros 46 equipos compitieron en tres rondas eliminatorias, a partidos de ida y vuelta (uno en casa y el otro fuera).

[3]​ Esta es la lista de participantes: ANG Angola BOT Botsuana BFA Burkina Faso CIV Costa de Marfil GAB Gabón GHA Ghana GUI Guinea EQG Guinea Ecuatorial LBY Libia MLI Malí MAR Marruecos NIG Níger SEN Senegal SUD Sudán TUN Túnez ZAM Zambia ALG Argelia BEN Benín BDI Burundi CPV Cabo Verde CMR Camerún CHA Chad CGO Congo EGY Egipto ETH Etiopía GAM Gambia GNB Guinea-Bisáu KEN Kenia LBR Liberia MAD Madagascar MWI Malaui MOZ Mozambique NAM Namibia NGA Nigeria CTA República Centroafricana COD República Democrática del Congo RWA Ruanda SLE Sierra Leona TAN Tanzania TOG Togo UGA Uganda ZIM Zimbabue LES Lesoto STP Santo Tomé y Príncipe SEY Seychelles SWZ Suazilandia Seychelles avanzó a la Primera fase y se enfrentó a RD Congo.