[5]​ Francia se la anexionó durante un breve periodo a principios del siglo XIX.

Siguió siendo un emplazamiento militar importante en la región durante las dos guerras mundiales y en la posguerra.

[7]​ En la actualidad, los edificios de la fortaleza albergan oficinas administrativas, apartamentos e instalaciones turísticas y culturales.

El edificio del antiguo cuartel inferior (en alemán: Untere Kaserne) se utiliza actualmente como archivo y centro administrativo del Comisionado Federal para los Archivos de la Stasi.

[8]​ Durante el periodo napoleónico se construyó una trinchera oculta que conectaba ambas ciudadelas.

[9]​ Formaba parte del Sacro Imperio Romano Germánico, y se incorporó a la diócesis de Maguncia en 755.

Los primeros registros del monasterio datan de 1060, pero es posible que ya existiera mucho tiempo antes.

Durante el siglo XII, la ciudad fue adquiriendo progresivamente mayor independencia, y en 1217 se independizó por completo con la constitución de su propio ayuntamiento.

[14]​[7]​ Los trabajos comprendieron la construcción de las murallas, los baluartes, los revellines llamados Anselm y Lothar, la puerta principal (Peterstor) y el edificio del comandante, tres cuarteles, que son algunos de los más antiguos que se conservan en Alemania, y las galerías intramuros, llamados en alemán Horchgänge, que significan "pasadizos de escucha".

[15]​[16]​ La segunda fase de construcción tuvo lugar entre 1707 y 1728, y estuvo dirigida por el arquitecto Maximilian von Welsch (1671-1745), a quien Carlos VI, emperador del Sacro Imperio Romano Germánico, nombró en 1714 caballero imperial con el título de Edler von Welsch por sus servicios a la arquitectura.

[5]​ Napoleón visitó la ciudad en varias ocasiones durante la ocupación francesa, y mostró un especial interés por la ciudadela de Petersberg.

[6]​ Cuando en 1814 los prusianos recuperaron la ciudadela, emprendieron una nueva fase de construcción que se prolongó hasta 1868.

La amenaza que suponían para la ciudad sus vecinos sajones y bávaros desapareció, razón por la cual se decidió derribar las murallas.

Además, para juzgar a los desertores, los nazis establecieron en la ciudadela un tribunal militar que podía dictar sentencias de muerte contra los encausados y que, en ocasiones, eran ejecutados inmediatamente allí mismo.

Hoy en día existe un monumento conmemorativo en homenaje a las víctimas de las torturas nazis.

[7]​ La guerra provocó diversos daños, como la Leonhardskirche (iglesia de San Leonardo), del siglo XII, que se había convertido en almacén de artillería y quedó totalmente destruida en un ataque aéreo.

[17]​ En 1949, la zona de ocupación soviética pasó a constituir la República Democrática Alemana (Alemania Oriental).

El Ejército Popular de Alemania Oriental (en alemán: Nationale Volksarmee) utilizó la ciudadela y sus cuarteles desde 1956 hasta 1963, fecha en la que se trasladó a unas nuevas instalaciones ubicadas en las afueras de la ciudad.

A lo largo del perímetro hay pequeñas torres de vigilancia integradas en las murallas.

[16]​ La Peterstor, la puerta principal de entrada a la ciudadela, se construyó entre 1666 y 1668.

[11]​ En noviembre de 1181 tuvo lugar en la iglesia una Dieta Imperial, que presidió el emperador del Sacro Imperio Romano Germánico Federico I, conocido como Barbarroja.

Tenía capacidad para unos 500 soldados y se construyó principalmente como posición de artillería para dificultar el acceso del enemigo al plano superior de la ciudadela desde el norte.

Tras la unificación de Alemania en 1871, se empleó fundamentalmente para alojar soldados y como almacén.

En 1912-1913 fue remodelado y ampliado con una mansarda de estilo neobarroco y se añadieron grandes ventanas abuhardilladas a ambos lados del edificio, de modo que su capacidad aumentó hasta los 750 soldados.

El cuartel se utilizó como edificio residencial y como cuartel de la policía civil y del Freikorps Thüringen, una unidad del ejército de milicias civiles.

[17]​ Tras la fundación de la República Democrática Alemana en 1949, la ciudadela volvió a tener un uso militar.

Se empleó como cuartel hasta el final de la Primera Guerra Mundial, en 1918.

En la actualidad es la sede del Comisionado Federal para los Archivos de la Stasi, en alemán Bundesbeauftragte für die Stasi-Unterlagen (BStU).

Todos los terceros jueves de cada mes se organizan exposiciones y visitas guiadas en alemán.

El vivandero era un comerciante que acompañaba al ejército para vender provisiones a los soldados.