El club pierde la categoría en la Primera Profesional Metropolitana de 1991 En la actualidad se encuentra desafiliado.

Ya en la Primera Profesional Metropolitano de 1990 afrontó problemas dirigenciales lo que provocó una seria crisis en el club (perdió tres puntos contra Octavio Espinoza) terminando en la novena y décima posición de ambos regionales metropolitanos.

Finalmente en la Primera Profesional Metropolitano de 1991 (año que bajaron muchos equipos debido al torneo Descentralizado venidero) el equipo azul terminó por descender a la Segunda División del Perú; pero por los problemas económicos y la crisis del club decidió no participar y desapareció para siempre.

Sin embargo, la mayor parte de sus jugadores fueron captados por otros clubes importantes del momento.

Durante sus encuentros en la Primera y Segunda División, Internationale usaba el Estadio Nacional de Lima como sede.