Como sede principal del museo, allí se albergan las oficinas principales de la institución, así como gran parte de las áreas administrativas del mismo.

Junto a estas dependencias, se encuentra la exposición permanente, que abarca el período histórico desde el proceso independentista del Uruguay, hasta la primera década del siglo XX; además de exposiciones itinerantes afines al museo.

Tras su fallecimiento, sucede el asesinato de su esposa, Celedonia, por el que las esclavas Mariquita y Encarnación fueron condenadas a la horca por el homicidio en un episodio que quedó marcado en la historia de la ciudad.

Luego, en el período entre 1834 y 1849, la propiedad pasa a manos del Gral.

Director”[2]​ En 1975, es declarado Monumento Histórico Nacional de acuerdo a la resolución N° 1097/975.

D. Fructuoso Rivera una finca que les pertenece y poseen en la calle de San Felipe [actual Misiones] de esta Capital…”[4]​ Las obras de mediados del siglo XIX son las que confieren al edificio la formalización característica que posee en la actualidad.

El acceso principal por calle Rincón y la finalización de la construcción del segundo nivel ya se evidencian en la fachada realizada por el Ing.

Alfredo R. Campos, con la colaboración de los arquitectos Ítalo Dighiero y Beltrán Arbeleche.