Su hermano Juan Guillermo de Cléveris tomó su lugar como sucesor.
Carlos Federico fue enterrado en la Basílica de Santa María la Mayor, la iglesia en Roma del Sacro Imperio Romano de la nación alemana.
Muestra, entre otras cosas, una escena del Juicio Final que cita en unos de las figuras la estatua de Laocoonte y sus hijos descubierta en 1506.
También incluye una estatua del Duque rezando de rodillas.
La inscripción que allí figura dice que Carlos Federico tenía un precoz sentido de la piedad, era brillante a pesar de su juventud y sabía muchas cosas y muchos idiomas.