[3]​ Los equipos que descendieron a la Serie B fueron Universidad Católica y Macará luego de quedar penúltimo y último respectivamente en la tabla acumulada entre las dos primeras etapas.

Universidad Católica, jugó en la Serie B del Campeonato de 2009 (año anterior).

Los clubes que jugaron el campeonato 2010 estuvieron conformados por los 10 mejores equipos de los 12 que disputaron el torneo de Serie A del 2009 y se complementó la lista con los 2 mejores equipos del torneo de Serie B del 2009, el Independiente y la Universidad Católica.

Además los tres primeros de esta etapa clasificarán a la Copa Sudamericana 2010.

La Tercera Etapa se jugará los días 5 y 12 de diciembre.

Consistirá en dos fechas en donde se disputará un partido de ida y uno de vuelta entre los equipos que hayan logrado el primer lugar en las etapas primera y segunda del campeonato.