Su corriente de agua de mar, que fluye entre las localidades gaditanas de San Fernando (situada en una isla), Chiclana de la Frontera y Puerto Real (en la Península), separa a Chiclana y a Puerto Real del tómbolo arenoso, donde se asientan Cádiz y San Fernando.

Desde el caño se pueden avistar varios núcleos de población asentados en torno a él, como San Fernando, Chiclana de la Frontera, Medina Sidonia, Puerto Real, etc.

Por el tramo medio se encuentra la isla del Vicario, perteneciente a San Fernando.

[1]​ En lo que respecta al litoral gaditano, el origen de la Bahía de Cádiz podría fecharse en torno al Mioceno superior, como resultado de una depresión tectónica que, durante el Plioceno y parte del Pleistoceno, quedó ocupada por un delta que configuró la línea de costa.

Los depósitos que fueron sedimentándose dieron lugar a los estuarios y las marismas que se asientan a las orillas del caño y que se han venido aprovechando a lo largo de los siglos como salinas.