La sede del parque se sitúa en San Fernando, junto al jardín botánico de la ciudad, destinado a la conservación de la flora autóctona.
Entre las especies de moluscos son abundantes las cañaíllas, verdigones, almejas, camarones y cangrejos, también presentes en las salinas donde además se capturan los llamados "pescados de estero": lenguados, lubinas, doradas, lisas...
Quedando el cauce anterior denominado Río San Pedro[11] Como todo territorio natural, la expansión de las zonas colindantes amenaza su integridad.
Hasta el día de hoy se están haciendo esfuerzos para ir recuperando el espacio natural, gestión que se realiza también dentro del ámbito del Parque Metropolitano Marismas de Los Toruños y Pinar de la Algaida incluido dentro del parque.
Algunos crítican sin embargo que la puesta en valor pone en peligro la recuperación de las especies del parque[cita requerida].