Así mismo, las instalaciones ferroviarias también cumplen funciones logísticas para el tráfico de mercancías.[2] Esto conllevó que la estación acogiera un activo tráfico de pasajeros y mercancías.Por este motivo, Bobadilla contó con unas importantes instalaciones ferroviarias, las cuales incluían una reserva de locomotoras que estuvo activa durante muchos años.[5] Tiempo después esta compañía comenzaría los trabajos para construir la línea Bobadilla-Granada, cuya construcción no se lograría finalizar hasta 1874.En su interior alberga una sala de espera, unas taquillas, servicios adaptados y aseos.También poseen acceso a andén al finalizar en toperas en los laterales del recinto las vías 7 y 5.La frecuencia de los trenes es relativamente alta, especialmente entre Sevilla y Málaga.
Un tren expreso tirado por una locomotora de la serie 319, en Bobadilla (1993).
