Estudió en Bolonia, al parecer con Lorenzo Sabatini y tal vez con Ercole Procaccini.Sin embargo, Zanguidi fue capaz de adaptar su estilo a las circunstancias y dejar los excesos manieristas cuando el encargo así lo requería.El Oratorio del Gonfalone (ejecutada en dos períodos: 1568-1569 y 1572) contiene su Entrada de Cristo en Jerusalén.Su contribución en este proyecto, que se reveló como uno de los más importantes del manierismo romano, no pudo ser mayor, debido a los constantes requerimientos del cardenal Alejandro Farnese, para quien decoró la Villa Farnese de Caprarola, sustituyendo a Federico Zuccaro, con quien había colaborado (1569) en la Sala di Ercole del citado palacio parmesano.Lamentablemente, el acento parmesano en estas obras es muy débil y se circunscriben en un estilo romano más sofisticado pero tal vez menos personal.