Finalmente, en 1436 fue nombrado obispo de Gerona.
En 1444 se trasladó a Roma donde residió durante dos años y medio.
En 1450, ya de regreso en Gerona y con la salud deteriorada, nombró como su auxiliar al obispo titular de Nicea.
Además, encargó la decoración del altar mayor así como la construcción de las pilas bautismales.
Su sobrino Joan Margarit i de Pau fue también obispo de Gerona así como un destacado humanista.