Durante este periodo, entrenó los soldados y milicianos que llevaron a cabo el Genocidio de Ruanda.

[1]​ Bizimungu Nació en Byumba, Mukaranje Comuna, Mugina Secteur, Nyange Cellule, Ruanda.

Aquel día, tras la muerte del Jefe de Estado Mayor Déogratias Nsabimana en un accidente aéreo que también mató al presidente Juvénal Habyarimana, Bizimungu fue promovido a general y nombrado como Jefe permanente del ejército.

[5]​ El juicio se suspendió hasta septiembre de 2008, en la que Bizimungo fue juzgado junto a otros oficiales de las FAR, como Augustin Ndindiliyimana (Jefe del Estado Mayor de la Gendarmería Nacional), François-Xavier Nzuwonemeye (Comandante del Batallón de Reconocimiento del Ejército ruandés) e Innocent Sagahutu (Comanadante Adjunto del Batallón de Reconocimiento del Ejército ruandés).

[7]​ Bizimungu fue interpretado por Fana Mokoena en la película de 2004, Hotel Rwanda.