[1]​ Los comunistas cubanos afirmaron más tarde que Matos estaba ayudando a planear una contrarrevolución organizada por la Agencia Central de Inteligencia de Estados Unidos y otros opositores a Castro.

El oficial que arrestó a Huber Matos y excolaborador de Castro, Camilo Cienfuegos, moriría pronto en un misterioso accidente aéreo poco después del incidente.

Las tierras expropiadas pasarían a ser de propiedad estatal y el recién formado Instituto de la Reforma Agraria (INRA) supervisaría las expropiaciones y estaría encabezado por Fidel Castro.

La oposición anticomunista dentro del gobierno cubano asumió que Fidel Castro no estaba al tanto de la creciente influencia comunista debido a las frecuentes negaciones públicas del comunismo por parte de Fidel Castro.

Matos creía que estas medidas se estaban volviendo demasiado entusiastas.

El 26 de julio, Fidel Castro y Huber Matos se reunieron en el Hotel Hilton de La Habana, donde, según Matos, Castro le dijo:"Tu renuncia no es aceptable en este momento.

[5]​Huber Matos había estado viajando a La Habana durante meses antes de su eventual renuncia.

En La Habana Matos realizó encuentros con varios funcionarios desde Manuel Ray Rivero hasta Manuel Fernández, y conversó sobre sus preocupaciones sobre la creciente influencia comunista y la necesidad de alertar a Fidel Castro.

[8]​ En respuesta, Fidel Castro realizó un mitin en el que pidió la reintroducción de tribunales revolucionarios para juzgar a Matos y Díaz Lanz por traición.

Según The New York Times, cuando Castro preguntó a la multitud si Matos debía ser fusilado:"[c]asi todas las manos se levantaron y la multitud volvió a gritar: '¡Pelotón de fusilamiento!

Felipe Pazos renunciaría como titular del Banco Nacional y sería reemplazado dentro de un mes por el Che Guevara.

También renunciaron los miembros del gabinete Manuel Ray Rivero y Faustino Pérez.

[3]​ Poco después del arresto de Matos, Fidel Castro y el Che Guevara pronunciaron un discurso ante miembros del INRA en el sentido de que Cuba continuaría girando hacia una dirección socialista.

Manuel Artime vio como precedente para su renuncia el arresto de Huber Matos y la afirmación del socialismo en Cuba.

Luego, Artime ingresó a una organización clandestina dirigida por jesuitas en Cuba para ocultar fugitivos.

Se involucró estrechamente con Gerry Droller (alias Frank Bender, alias "Mr B") de la CIA en el reclutamiento y organización de exiliados cubanos en Miami para futuras acciones contra el gobierno cubano.

Participaron Manuel Antonio de Varona, José Miró Cardona , Rafael Quintero, Aureliano Sánchez Arango.

Existe cierto debate con respecto a la muerte de Cienfuegos, aunque los historiadores cubanos no creen que haya habido juego sucio por parte del gobierno.

[15]​El tribunal fue constituido por los comandantes Dermidio Escalona, Guillermo García Frías, Universo Sánchez, Orlando Rodríguez Puerta, presidio Sergio del Valle, oficial a cargo de la Dirección de Operaciones del Estado Mayor.

[18]​ También despotrico en contra del abogado de Huber Matos Francisco Lorié Bertot.

Igualmente fueron condenados Roberto Cruzo Zamora, Ángel Rosendo Lugo, Ángel Ruiz Maceira a 7 años; Jesús N. Becquer Cobas, Vicente Rodríguez Camejo, Miguel A. Crespo Garda, Rodobaldo Ll. Ramos, Eluvio Rivera Limonta, José A. Pérez Álamo, Manuel Nieto, William Lobrina Galdos, Jésus A. Torres Calunga, Manuel Esquivel Ramos, José López Legón, José Martí Ballester, 3 años y Raúl Barandela, Eduardo Bonet Rosell, Dionisio Suárez Esquivel, Mario Santana Basulto y Carlos Álvarez Ramírez, fueron sancionados a 2 años de prisión.

Llegaron en botes a Cayo Hueso, continuando viaje en avión hacia Miami, donde pidieron asilo político.