En abril, Bonaparte es informado de que un gran ejército turco se podría estar concentrando en torno al Jordán para atacarle por su retaguardia y socorrer a los sitiados, con víveres de sobra y con los que colaboran los británicos.
Napoleón encomienda una parte de sus tropas al general Kléber para realizar un reconocimiento del río Jordán.
Bonaparte achaca la victoria otomana en Acre a la presencia del comodoro Smith.
Los franceses han perdido más de 2.000 hombres en el sitio de Acre, casi todos por enfermedad, y varios miles más están aún convalecientes.
El 20 de mayo, Napoleón levanta el sitio del Acre y al día siguiente el contingente francés se retira hacia Egipto, a donde sólo retornarán unos 7000 soldados.