La necesidad de almacenarlo dentro del submarino exigía compromisos en diseño por lo que este prototipo fue poco utilizado.Tenía una forma bastante pequeña y atractiva y las alas podían plegarse una sobre la otra para que cupiera en un compartimiento estanco del submarino; sin embargo, las pruebas demostraron que era difícil de controlar tanto en el aire como en el agua por lo que el proyecto fue abandonado a favor del helicóptero cometa Focke-Achgelis Fa 330 Bachstelze.Para facilitar el almacenamiento las alas del Ar 231 el avión contaba con secciones desmontables que dos operadores podían manejar en menos de seis minutos.Durante 1941 se terminaron seis prototipos, todos ellos propulsados con motores Hirth HM 501.Las pruebas revelaron que el Ar 231 era frágil, poco potente y difícil de volar incluso con buen tiempo.
