[1]​ Su enclave es en pleno Prepirineo aragonés y el Conjunto Histórico de Serrablo.

Aquilué está situado en el valle homónimo, en el que el río Matriz es el eje principal, entre las sierras de Javierre y Puenta Pueyo, que a su vez separan a este del valle de la Garona, el Flumen y el Isuela al sur, y la Guarguera al norte.

Se accede a Aquilué por ferrocarril con la mítica línea del Canfranero.

El acceso más rápido al pueblo es por carretera, por el oeste por la N-330, accediendo por Hostal de Ipiés, o bien por la Autovía Mudéjar por Escusaguás.

Está situada en un pequeño alto a las afueras de la población y tiene el cementerio anexo en el lado este.