En 1966, en plena dictadura, obtiene el título de master en química orgánica.

[1]​ A principios del decenio de 1970, Anita se exilia en la URSS.

Fue juzgada en rebeldía en junio de 1973, y condenada, en ausencia, a cuatro años y seis meses de prisión por el "Consejo Permanente de Justicia para el Ejército" (la Corte Suprema del Ejército).

En enero de 1990, Prestes recibió un doctorado en Historia de la Universidad Federal Fluminense, defendiendo la tesis A Coluna Prestes (La Columna Prestes), que fue el movimiento comandado por su padre, y que con al menos 1.500 militantes, combatieron contra Artur Bernardes (1875-1955), en su presidencia entre 1922 a 1926.

[3]​ En 2011 continúa como profesora asociada retirada de Historia de Brasil, puesto que oposicionó por concurso público en 1992, y retirándose en 2007.