[1]​ Andoni se crio en las categorías inferiores de la Cultural Durango.

En su primera temporada en el club bilbaíno disputó 29 partidos oficiales.

En enero de 1984 recaló en el Cádiz CF, también en Primera División, con el que disputó 15 partidos.

En el equipo maño pasó doce temporadas, disputando más de 340 partidos oficiales, siendo uno de los jugadores más queridos de la historia del Real Zaragoza y el guardameta que más partidos ha jugado con el club maño.

[2]​ Su último año como profesional, también en la máxima categoría, estuvo ligado al CD Logroñés, aunque no pudo evitar el descenso al final de la campaña.