Estos son elegido por votación popular y lideran los llamados gobiernos autónomos descentralizados cantonales que actúan de forma independiente al gobierno central.
[2] En 1966, la Junta Militar promulgó una nueva ley de régimen municipal que permitió a todos los concejos municipales del país designar a un Alcalde y crear la Alcaldía Municipal del cantón o designar al Presidente del Concejo para que ejerza la Alcaldía de forma simultánea, haciendo uso de estas nuevas funciones algunos cantones del país, pero esta facultad fue retirada en 1970 bajo la dictadura de Velasco Ibarra y por las reformas a la ley del régimen municipal de 1971.
[3][4] Entre 1970 y 1978, los alcaldes fueron nuevamente designados por Decretos Supremos durante las dictaduras de José María Velasco Ibarra (1970-1972), Guillermo Rodríguez Lara (1972-1976) y del Consejo Supremo de Gobierno (1976-1979), sin tener períodos fijos.
A partir de 1996, tras cambios constitucionales realizados por el Congreso Nacional, todos los cantones del país cuentan con un alcalde electo en votación popular.
[5][6] El alcalde a su vez dirige en concejo cantonal con voto dirimente, y en su ausencia temporal o definitiva será reemplazado por la persona que ejerza la vicealcaldia, elegida por el concejo cantonal de entre sus miembros.