Mientras que su primo Salvador fue enviado a estudiar a Europa, Agustín permaneció al lado de Maximiliano y Carlota, quienes desde entonces y hasta el fin del Segundo Imperio Mexicano, se encargaron junto con su tía, la Princesa Josefa, de la educación del pequeño.

Tras haber sido abolido el Segundo Imperio Mexicano en 1867, sus padres lo enviaron a estudiar a Inglaterra, tras lo cual regresó a los Estados Unidos para estudiar en la Universidad de Georgetown, donde justo después de haberse graduado, regresó a México en donde siguió la carrera militar en el ejército mexicano, pero después de haber publicado su inconformidad al régimen dictatorial de Porfirio Díaz, fue arrestado y prisionero por sedición durante 11 meses.

[7]​ Al salir de prisión, fue expulsado de país al exilio, motivo que lo llevó a tener dos crisis nerviosas al creer que lo podrían asesinar inclusive los gobiernos posteriores de Victoriano Huerta y Venustiano Carranza.

Contrajo matrimonio, en primeras nupcias, en 1894 con Lucy Eleanor Hatchett (1862-1940) y en segundas en 1915 con María Luisa Kearney (1872-1967), pero no tuvo descendencia.

Sus restos fueron sepultados en la iglesia de San Juan Evangelista en Filadelfia.