El Comisionado para Asuntos Culturales Shunichi Tokura dirige la agencia desde abril de 2021.
La agencia está compuesta por tres divisiones principales: la secretaría, el departamento de Asuntos Culturales y el departamento de Patrimonio Cultural.
La agencia también incluye la Academia de las Artes de Japón y varias comisiones especializadas para llevar a cabo los estudios pertinentes.
La Academia honra a personas eminentes de las artes y las letras, nombrándolas miembros y ofreciendo 3,5 millones de yenes en premios.
En 1989, por primera vez, dos mujeres -una escritora y una diseñadora de vestuario- fueron nominadas para la Orden del Mérito Cultural, otro honor oficial con el mismo premio monetario.