Aceca proviene del árabe السِّكَّة as-sikka, que significa ‘el camino’.

[1]​ La localidad aparece mencionada como as-Sikka en documentos mozárabes de Toledo, donde se le menciona como un vado que cruzaba el río Tajo.

[2]​ El lugar aparece posteriormente mencionado como una antigua villa,[3]​ perteneciente al término de Villaseca de la Sagra y del que se mencionaban una casa y un oratorio, además de la antigua existencia de un palacio (véase Casa Real de Aceca).

Era ya mencionado como un despoblado a mediados del siglo XIX.

A comienzos del siglo XXI se acordó el traslado de los vecinos del antiguo núcleo a un poblado construido en origen para los trabajadores de la central.