Tommaso de Moriana vino desde Jerusalén por una visión y la reconstruyó en el siglo VII.

El siglo VIII recibió la protección del duque Faroald II de Spoleto que le cedió extensos territorios otorgándole privilegios y se convirtió de hecho un estado independiente entre el dominio del papa y el ducado lombardo.

Fue aumentando su poder y en el siglo IX el abad Ingoald, incluso disponía de alguna nave comercial con franquicias.

Fue el abad Ugo I (997-1038) quien enderezó la situación y en el 999 introdujo la reforma de Cluny.

Hacia la mitad del siglo XIV el abad fue excomulgado por no poder pagar el diezmo a la cámara apostólica.