ATAC-seq

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing en inglés) es una técnica epigenómica que sirve para determinar la accesibilidad de la cromatina en un genoma.

[3]​ ATAC-seq comprende una tecnología epigenética innovadora que es un método para mapear la cromatina accesible al [5]​cargar una transposasa Tn5 hiperactiva con adaptadores para la secuenciación de DNA agregadas artificialmente.

En la técnica se emplea Tn5 y su actividad transposasa para fragmentar e integrar estos adaptadores en las regiones de la cromatina que sean accesibles, mientras que apenas se modificarán las regiones condensadas debido a un impedimento estérico; el resultado son millones de fragmentos de ADN que ,tras la inserción, se construyen las bibliotecas para secuenciación de los fragmentos.

[2]​[5]​ Se ha establecido que ATAC-seq puede ser utilizado para caracterizar los cambios dinámicos epigenéticos en el proceso de agotamiento de células T que ocurre en procesos patológicos ligados a infecciones y cáncer.

En la oncogénesis dependiente de Ras hay 3778 regiones reguladoras sobreactivadas detectadas por ATAC-seq.