Igualmente su fama le viene por producir algunos documentales como Comandante de Oliver Stone e Hijos de las Nubes, la última colonia (documental que ilustra el conflicto saharaui), dirigido por el propio Álvaro, ganador del Premio Goya a la mejor película documental en 2013,[3]​ y protagonizada por Javier Bardem.

La cinta se presentó en la sección Zabaltegi del Festival Internacional de Cine de San Sebastián,[5]​ entre otros, y fue nominada a los Premios Goya 2016.

[7]​ El documental Dos Cataluñas, dirigido por Álvaro Longoria junto a Gerardo Olivares y producido por Netflix, fue galardonado con el premio Cinema for Peace (2019).

La película recibió recientemente el premio Honorary Green Oscar otorgado por la Fundación Cinema por la Paz.

En 2012, Álvaro se estrenó como director con Hijos de las nubes, la última colonia, un documental sobre la situación del pueblo saharaui, coproducido por Javier Bardem.