stringtranslate.com

Pseudomonas aeruginosa

Pseudomonadota (sinónimo Proteobacteria ) es un filo importante de bacterias Gram-negativas . [10] Actualmente, se consideran el filo predominante dentro del reino de las bacterias. [11] Se encuentran naturalmente como géneros patógenos y de vida libre (no parásitos ). [11] El filo comprende seis clases Acidithiobacillia , Alphaproteobacteria , Betaproteobacteria , Gammaproteobacteria , Hydrogenophilia y Zetaproteobacteria . [11] Los Pseudomonadota son ampliamente diversos, con diferencias en morfología , procesos metabólicos , relevancia para los humanos e influencia ecológica . [11]

Clasificación

El microbiólogo estadounidense Carl Woese estableció esta agrupación en 1987, llamándola informalmente las "bacterias púrpuras y sus parientes". [12] Posteriormente, el grupo recibió el nombre formal de "Proteobacteria" en honor al dios griego Proteo, que era conocido por asumir muchas formas. [13] En 2021, el Comité Internacional de Sistemática de Procariotas designó el sinónimo Pseudomonadota y también renombró muchos otros filos procariotas. [1] Este cambio de nombre de varios filos procariotas en 2021, incluido Pseudomonadota, sigue siendo controvertido entre los microbiólogos, muchos de los cuales continúan usando el nombre anterior Proteobacteria, de larga data en la literatura. [14] El filo Pseudomonadota abarca las clases Acidithiobacillia, Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Hydrogenophilia y Zetaproteobacteria. [11] El filo incluye una amplia variedad de géneros patógenos , como Escherichia , Salmonella , Vibrio , Yersinia , Legionella y muchos otros. [15] Otros son de vida libre (no parásitos ) e incluyen muchas de las bacterias responsables de la fijación de nitrógeno . [16]

Anteriormente, el filo Pseudomonadota incluía dos clases adicionales, a saber, Deltaproteobacteria y Oligoflexia . Sin embargo, una investigación más profunda de la filogenia de estos taxones a través del análisis de marcadores genómicos demostró su separación del filo Pseudomonadota. [17] Deltaproteobacteria ha sido identificada como una unidad taxonómica diversa , lo que llevó a una propuesta para su reclasificación en filos distintos: Desulfobacterota (que abarca Thermodesulfobacteria ), Myxococcota y Bdellovibrionota (que comprende Oligoflexia ). [17]

La clase Epsilonproteobacteria también se identificó dentro del filo Pseudomonadota. Esta clase se caracteriza por su importancia como productores primarios quimiolitotróficos y su destreza metabólica en los ecosistemas de respiraderos hidrotermales de aguas profundas . [18] Los géneros patógenos notables dentro de esta clase incluyen Campylobacter , Helicobacter y Arcobacter . El análisis de la topología del árbol filogenético y los marcadores genéticos revelaron la divergencia directa de Epsilonproteobacteria del filo Pseudomonadota. [18] Los datos limitados del grupo externo y los valores bajos de bootstrap respaldan estos descubrimientos. A pesar de más investigaciones, no se ha llegado a un consenso con respecto a la naturaleza monofilética de Epsilonproteobacteria dentro de Proteobacteria, lo que llevó a los investigadores a proponer su separación taxonómica del filo. La reclasificación propuesta del nombre Epsilonproteobacteria es Campylobacterota . [18]

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LSPN) [19] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [20]

El grupo Pseudomonadota se define en base a la secuenciación del ARN ribosómico (ARNr) y se divide en varias subclases. Estas subclases se consideraron como tales durante muchos años, pero ahora se tratan como varias clases del filo. Estas clases son monofiléticas . [21] [22] [23] El género Acidithiobacillus , parte de Gammaproteobacteria hasta que se transfirió a la clase Acidithiobacillia en 2013, [2] se consideraba anteriormente como parafilético de Betaproteobacteria según estudios de alineamiento multigenomático . [24] En 2017, Betaproteobacteria fue objeto de importantes revisiones y se creó la clase Hydrogenophilalia para contener el orden Hydrogenophilales [4]

Las clases de Pseudomonadota con nombres publicados válidamente incluyen algunos géneros destacados: [25] por ejemplo:

Características

Los pseudomonadota son un grupo diverso. Aunque algunas especies pueden teñirse como Gram-positivas o Gram-variables en el laboratorio, nominalmente son Gram-negativas . Su membrana externa única está compuesta principalmente de lipopolisacáridos , lo que ayuda a diferenciarlas de las especies Gram-positivas. [32] La mayoría de los pseudomonadota son móviles y se desplazan utilizando flagelos. Muchos se desplazan utilizando flagelos , pero algunos son inmóviles o dependen del deslizamiento bacteriano . [33]

Los pseudomonadota tienen una amplia variedad de tipos de metabolismo . La mayoría son anaerobios facultativos u obligados , quimiolitoautótrofos y heterótrofos , aunque existen numerosas excepciones. Una variedad de géneros distantemente relacionados dentro de los pseudomonadota obtienen su energía de la luz a través de la fotosíntesis convencional o la fotosíntesis anoxigénica . [33]

Acidithiobacillia contiene solo autótrofos oxidantes de azufre, hierro y uranio . El orden tipo es Acidithiobacillaceae , que incluye cinco especies diferentes de Acidithiobacillus utilizadas en la industria minera. En particular, estos microbios ayudan con el proceso de biolixiviación , que implica que los microbios asistan en la extracción de metales de los desechos mineros que normalmente los métodos de extracción no pueden eliminar. [34]

Algunas Alphaproteobacteria pueden crecer con niveles muy bajos de nutrientes y tienen una morfología inusual dentro de sus ciclos de vida. Algunas forman tallos para ayudar con la colonización y forman brotes durante la división celular. Otras incluyen bacterias importantes para la agricultura capaces de inducir la fijación de nitrógeno en simbiosis con plantas. El orden tipo es Caulobacterales , que comprende bacterias formadoras de tallos como Caulobacter . [35] Se cree que las mitocondrias de los eucariotas son descendientes de una alphaproteobacteria. [36]

Las Betaproteobacteria son altamente diversas metabólicamente y contienen quimiolitoautótrofos , fotoautótrofos y heterótrofos generalistas . El orden tipo es Burkholderiales , que comprende una enorme gama de diversidad metabólica, incluidos patógenos oportunistas . Estos patógenos son primarios tanto para humanos como para animales, como el patógeno de los caballos Burkholderia mallei y Burkholderia cepacia , que causa infecciones del tracto reparador en personas con fibrosis quística. [37]

Las Gammaproteobacteria son una de las clases más numerosas en términos de géneros, y contienen aproximadamente 250 nombres publicados de forma válida. [24] El orden tipo es Pseudomonadales , que incluye los géneros Pseudomonas y Azotobacter , que fija nitrógeno , junto con muchos otros. Además de ser un género patógeno bien conocido, Pseudomonas también es capaz de biodegradar ciertos materiales, como la celulosa. [35]

Las Hydrogenophilalia son quimioheterótrofas y autótrofas termófilas. [38] Las bacterias suelen utilizar gas hidrógeno como donante de electrones, pero también pueden utilizar compuestos sulfúricos reducidos. Debido a esta capacidad, los científicos han comenzado a utilizar ciertas especies de Hydrogenophilalia para eliminar sulfuros que contaminan los sistemas de aguas residuales industriales. El orden tipo es Hydrogenophilaceae que contiene los géneros Thiobacillus, Petrobacter, Sulfuricella, Hydrogenophilus y Tepidiphilus . Actualmente, no se ha identificado ningún miembro de esta clase como patógeno. [39]

Las Zetaproteobacteria son quimiolitoautótrofos neutrófilos oxidantes de hierro , distribuidos por todo el mundo en estuarios y hábitats marinos. [33] Este grupo tiene tanto éxito en su entorno debido a su naturaleza microaerófila. Debido a que requieren menos oxígeno que el que está presente en la atmósfera, pueden competir con la oxidación abiótica del hierro (II) que ya está ocurriendo en el medio ambiente. [40] El único orden tipo confirmado para esta clase es Mariprofundaceae , que no contiene ninguna especie patógena conocida. [41]

Transformación

La transformación , un proceso en el que el material genético pasa de una bacteria a otra, [42] se ha descrito en al menos 30 especies de Pseudomonadota distribuidas en las clases alfa, beta y gamma. [43] Las Pseudomonadota mejor estudiadas con respecto a la transformación genética natural son los patógenos humanos de importancia médica Neisseria gonorrhoeae (clase beta) y Haemophilus influenzae (clase gamma). [44] La transformación genética natural es un proceso sexual que implica la transferencia de ADN de una célula bacteriana a otra a través del medio intermedio y la integración de la secuencia donante en el genoma receptor. En Pseudomonadota patógenos, la transformación parece servir como un proceso de reparación del ADN que protege el ADN del patógeno del ataque de las defensas fagocíticas de su anfitrión que emplean radicales libres oxidativos . [44]

Hábitat

Debido a la naturaleza distintiva de cada una de las seis clases de Pseudomonadota, este filo ocupa una multitud de hábitats, entre los que se incluyen:

Significado

Salud humana

Los estudios han sugerido que Pseudomonadota es una firma relevante de enfermedad en el tracto gastrointestinal (GI) humano, al operar como un marcador de inestabilidad de la microbiota. [10] El microbioma intestinal humano consta principalmente de cuatro filos: Firmicutes , Bacteroidetes , Actinobacteria y Pseudomonadota. [10] La colonización intestinal de microorganismos es dinámica desde el nacimiento hasta la muerte, con estabilización en los primeros años de vida, a mayor diversidad en adultos, a diversidad reducida en ancianos. [10] El microbioma intestinal lleva a cabo procesos como la síntesis de nutrientes, el metabolismo químico y la formación de la barrera intestinal. [10] Además, el microbioma intestinal facilita las interacciones del huésped con su entorno circundante a través de la regulación de la absorción de nutrientes y la ingesta bacteriana. En estudios de secuenciación de ARNr 16s y metagenoma , se ha identificado a Proteobacteria como bacteria que provoca endotoxemia (una respuesta intestinal inflamatoria) y trastornos metabólicos en los tractos GI humanos. [10] Otro estudio de Michail et al. mostró una correlación de la composición microbiana en niños con y sin enfermedad del hígado graso no alcohólico (NAFLD), en donde los pacientes con NAFLD tienen una mayor abundancia de Gammaproteobacteria que los pacientes sin la enfermedad. [50]

Las clases Betaproteobacteria y Gammaproteobacteria prevalecen dentro de la cavidad oral humana y son marcadores de una buena salud oral. [45] El microbioma oral consta de 11 hábitats, incluidos el dorso de la lengua, el paladar duro , las amígdalas, la garganta, la saliva y más. [51] Los cambios en el microbioma oral se deben a factores endógenos y exógenos como el estilo de vida del huésped, el genotipo , el medio ambiente, el sistema inmunológico y el estado socioeconómico . [51] Considerando la dieta como un factor, el alto contenido de ácidos grasos saturados (SAF), logrado a través de una mala dieta, se ha correlacionado con una mayor abundancia de Betaproteobacteria en la cavidad oral. [51]

Valor económico

Las bacterias Pseudomonadota tienen una asociación simbiótica o mutualista con las raíces de las plantas, un ejemplo de ello es el rizoma de las plantas de papa. [52] Debido a esta relación simbiótica, los agricultores tienen la capacidad de aumentar el rendimiento de sus cultivos. [52] Los sistemas de raíces más saludables pueden conducir a una mejor absorción de nutrientes, una mejor retención de agua, una mayor resistencia a enfermedades y plagas y, en última instancia, mayores rendimientos de los cultivos por acre. [53] El aumento de la producción agrícola puede impulsar el crecimiento económico, contribuir a la seguridad alimentaria y conducir a la creación de empleo en las zonas rurales. [54]

Como se mencionó brevemente en secciones anteriores, los miembros de Pseudomonadota tienen vastas capacidades metabólicas que les permiten utilizar y producir una variedad de compuestos. La biolixiviación , realizada por varias especies de Thiobacillus , es un ejemplo principal de esto. [55] Cualquier especie oxidante de hierro y azufre tiene el potencial de descubrir metales y minerales de baja calidad que las técnicas de minería convencionales no podían extraer. En la actualidad, se utilizan con mayor frecuencia para recuperar cobre y uranio, pero los investigadores buscan expandir este campo en el futuro. La desventaja de este método es que las bacterias producen subproductos ácidos que terminan en el drenaje ácido de las minas . La biolixiviación tiene una promesa económica significativa si se puede controlar y no causar más daños al medio ambiente. [34]

Impacto ecológico

Los pseudomonadota son microbios que se encuentran comúnmente en los sistemas del suelo. [52] Los microbios juegan un papel crucial en el ecosistema circundante al realizar funciones como el ciclo de nutrientes , la fijación de dióxido de carbono, la descomposición y la fijación de nitrógeno. [56] Los pseudomonadota pueden describirse como fotótrofos , heterótrofos y litotrofos . Como heterótrofos (ejemplos Pseudomonas y Xanthomonas ), estas bacterias son efectivas para descomponer la materia orgánica, lo que contribuye al ciclo de nutrientes. [56] Además, los fotolitotrofos dentro del filo pueden realizar la fotosíntesis utilizando sulfuro o azufre elemental como donantes de electrones , lo que les permite participar en la fijación de carbono y la producción de oxígeno incluso en condiciones anaeróbicas . [56] Estas bacterias Pseudomonadota también se consideran organismos copiotróficos , lo que significa que se pueden encontrar en entornos con alta disponibilidad de nutrientes. [56] Estos ambientes tienen abundantes fuentes de carbono y otros nutrientes, como suelos fértiles, abono y aguas residuales. Estas bacterias copiotróficas pueden mejorar la salud del suelo mediante el ciclo de nutrientes y la descomposición de desechos. [56]

Debido a que este filo puede formar una relación simbiótica con las raíces de las plantas, la incorporación de Pseudomonadota en las prácticas agrícolas se alinea con los principios de la agricultura sustentable . [57] [52] Estas bacterias contribuyen a la salud y fertilidad del suelo, promueven el manejo natural de plagas y mejoran la resiliencia de los cultivos a los factores estresantes ambientales. [57]

Véase también

Referencias

  1. ^ ab Oren A, Garrity GM (octubre de 2021). "Publicación válida de los nombres de cuarenta y dos filos de procariotas". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID  34694987. S2CID  239887308.
  2. ^ abc Williams KP, Kelly DP (agosto de 2013). "Propuesta para una nueva clase dentro del filo Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., con el orden tipo Acidithiobacillales, y descripción enmendada de la clase Gammaproteobacteria". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 63 (Pt 8): 2901–2906. doi :10.1099/ijs.0.049270-0. PMID  23334881. S2CID  39777860.
  3. ^ Garrity GM, Bell JA, Lilburn T (2005). "Clase I. Clase Alphaproteobacteria . nov." En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . Vol. 2 (Proteobacteria), Parte C (Las Alpha-, Beta-, Delta- y Epsilonproteobacteria) (2.ª ed.). Springer. p. 1. doi :10.1002/9781118960608.cbm00041. ISBN 978-1-118-96060-8.
  4. ^ abc Boden R, Hutt LP, Rae AW (mayo de 2017). "Reclasificación de Thiobacillus aquaesulis (Wood y Kelly, 1995) como Annwoodia aquaesulis gen. nov., comb. nov., transferencia de Thiobacillus (Beijerinck, 1904) de Hydrogenophilales a Nitrosomonadales, propuesta de clase Hydrogenophilalia. nov. dentro de 'Proteobacteria', y cuatro nuevas familias dentro de los órdenes Nitrosomonadales y Rhodocyclales". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 67 (5): 1191–1205. doi : 10.1099/ijsem.0.001927 . hdl : 10026.1/8740 . PMID  28581923.
  5. ^ Emerson D, Rentz JA, Lilburn TG, Davis RE, Aldrich H, Chan C, et al. (agosto de 2007). "Un nuevo linaje de proteobacterias implicadas en la formación de comunidades de tapetes microbianos oxidantes de Fe marinos". PLOS ONE . ​​2 (7): e667. Bibcode :2007PLoSO...2..667E. doi : 10.1371/journal.pone.0000667 . PMC 1930151 . PMID  17668050. 
  6. ^ Stackebrandt E, Murray RG, Trüper HG (1988). "Proteobacteria classis nov., un nombre para el taxón filogenético que incluye las "bacterias púrpuras y sus parientes"". Revista Internacional de Bacteriología Sistemática . 38 (3): 321–325. doi : 10.1099/00207713-38-3-321 .
  7. ^ ab Gray JP, Herwig RP (noviembre de 1996). "Análisis filogenético de las comunidades bacterianas en sedimentos marinos". Applied and Environmental Microbiology . 62 (11): 4049–4059. Bibcode :1996ApEnM..62.4049G. doi :10.1128/aem.62.11.4049-4059.1996. PMC 168226 . PMID  8899989. 
  8. ^ Garrity GM, Bell JA, Lilburn T (2005). "Filo XIV. Proteobacteria phyl. nov." En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . Vol. 2 (Proteobacteria), Parte B (Gammaproteobacteria) (2.ª ed.). Nueva York, NY: Springer. pág. 1.
  9. ^ Cavalier-Smith T (enero de 2002). "El origen neomurano de las arqueobacterias, la raíz negibacteriana del árbol universal y la megaclasificación bacteriana". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 52 (Pt 1): 7–76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID  11837318.
  10. ^ abcdefg Rizzatti G, Lopetuso LR, Gibiino G, Binda C, Gasbarrini A (2017). "Proteobacterias: un factor común en las enfermedades humanas". Investigación BioMed Internacional . 2017 : 9351507. doi : 10.1155/2017/9351507 . PMC 5688358 . PMID  29230419. 
  11. ^ abcdefghij Kersters K, De Vos P, Gillis M, Swings J, Vandamme P, Stackebrandt E (2006). "Introducción a las Proteobacterias". En Dworkin M, Falkow S, Rosenberg E, Schleifer KH (eds.). Los Procariotas. vol. 5: Proteobacterias: Subclases Alfa y Beta. Nueva York, Nueva York: Springer. págs. 3–37. doi :10.1007/0-387-30745-1_1. ISBN 978-0-387-30745-9. Recuperado el 12 de abril de 2024 .
  12. ^ Woese CR (junio de 1987). "Evolución bacteriana". Microbiological Reviews . 51 (2): 221–271. doi :10.1128/MMBR.51.2.221-271.1987. PMC 373105 . PMID  2439888. 
  13. ^ Moon CD, Young W, Maclean PH, Cookson AL, Bermingham EN (octubre de 2018). "Información metagenómica sobre el papel de las proteobacterias en los microbiomas gastrointestinales de perros y gatos sanos". MicrobiologyOpen . 7 (5): e00677. doi :10.1002/mbo3.677. PMC 6182564 . PMID  29911322. 
  14. ^ Robitzski D (4 de enero de 2022). "Los filos procariotas recientemente renombrados causan revuelo". The Scientist .
  15. ^ Slonczewski JL, Foster JW, Foster E (2020). Microbiología: una ciencia en evolución (5.ª ed.). WW Norton & Company.
  16. ^ Sah S, Krishnani S, Singh R (diciembre de 2021). "Actividades de promoción nutricional y del crecimiento mediadas por Pseudomonas para la seguridad alimentaria sostenible". Investigación actual en ciencias microbianas . 2 : 100084. doi :10.1016/j.crmicr.2021.100084. PMC 8645841. PMID  34917993 . 
  17. ^ ab Waite DW, Chuvochina M, Pelikan C, Parks DH, Yilmaz P, Wagner M, et al. (noviembre de 2020). "Propuesta para reclasificar las clases proteobacterianas Deltaproteobacteria y Oligoflexia, y el filo Thermodesulfobacteria en cuatro filos que reflejan capacidades funcionales importantes". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 70 (11): 5972–6016. doi : 10.1099/ijsem.0.004213 . PMID  33151140.
  18. ^ abc Waite DW, Vanwonteghem I, Rinke C, Parks DH, Zhang Y, Takai K, et al. (2017). "Análisis genómico comparativo de la clase Epsilonproteobacteria y reclasificación propuesta a Epsilonbacteraeota (fil. nov.)". Frontiers in Microbiology . 8 : 682. doi : 10.3389/fmicb.2017.00682 . PMC 5401914 . PMID  28484436. 
  19. ^ Euzéby JP. "Pseudomonadota". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 20 de marzo de 2016 .
  20. ^ Sayers. "Proteobacteria". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 20 de marzo de 2016 .
  21. ^ Krieg NR, Brenner DJ, Staley JT (2005). Manual de bacteriología sistemática de Bergey . Vol. 2: Proteobacteria. Springer. ISBN 978-0-387-95040-2.
  22. ^ Ciccarelli FD, Doerks T, von Mering C, Creevey CJ, Snel B, Bork P (marzo de 2006). "Hacia la reconstrucción automática de un árbol de la vida altamente resuelto". Science . 311 (5765): 1283–1287. Bibcode :2006Sci...311.1283C. CiteSeerX 10.1.1.381.9514 . doi :10.1126/science.1123061. PMID  16513982. S2CID  1615592. 
  23. ^ Yarza P, Ludwig W, Euzéby J, Amann R, Schleifer KH, Glöckner FO, et al. (octubre de 2010). "Actualización del proyecto All-Species Living Tree Project basado en análisis de secuencias de ARNr 16S y 23S". Microbiología sistemática y aplicada . 33 (6): 291–299. Bibcode :2010SyApM..33..291Y. doi :10.1016/j.syapm.2010.08.001. PMID  20817437.
  24. ^ ab Williams KP, Gillespie JJ, Sobral BW, Nordberg EK, Snyder EE, Shallom JM, et al. (mayo de 2010). "Filogenia de gammaproteobacteria". Revista de bacteriología . 192 (9): 2305–2314. doi :10.1128/JB.01480-09. PMC 2863478 . PMID  20207755. 
  25. ^ "Árbol interactivo de la vida". Heidelberg, DE: Laboratorio Europeo de Biología Molecular . Archivado desde el original el 23 de febrero de 2022. Consultado el 23 de febrero de 2022 .
  26. ^ "El proyecto del árbol vivo de todas las especies (LTP)" . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  27. ^ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  28. ^ "Notas de la versión LTP_12_2021" (PDF) . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  29. ^ "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  30. ^ "bac120_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  31. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  32. ^ Silhavy TJ, Kahne D, Walker S (1 de mayo de 2010). "La envoltura celular bacteriana". Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 2 (5): a000414. doi :10.1101/cshperspect.a000414. ISSN  1943-0264. PMC 2857177 . PMID  20452953. 
  33. ^ abc "Pseudomonadota Garrity et al., 2021". www.gbif.org . Consultado el 18 de abril de 2024 .
  34. ^ por Kelly DP, Wood AP (2014), Rosenberg E, DeLong EF, Lory S, Stackebrandt E (eds.), "La familia Acidithiobacillaceae", The Prokaryotes: Gammaproteobacteria , Berlín, Heidelberg: Springer, págs. 15-25, doi :10.1007/978-3-642-38922-1_250, ISBN 978-3-642-38922-1, consultado el 18 de abril de 2024
  35. ^ ab Bandopadhyay S, Shade A (2024), "Bacterias y arqueas del suelo", Microbiología, ecología y bioquímica del suelo , Elsevier, págs. 41–74, doi :10.1016/b978-0-12-822941-5.00003-x, ISBN 978-0-12-822941-5, consultado el 18 de abril de 2024
  36. ^ Roger AJ, Muñoz-Gómez SA, Kamikawa R (noviembre de 2017). "El origen y la diversificación de las mitocondrias". Current Biology . 27 (21): R1177–R1192. Bibcode :2017CBio...27R1177R. doi : 10.1016/j.cub.2017.09.015 . ISSN  0960-9822. PMID  29112874.
  37. ^ Coenye T (2014), Rosenberg E, DeLong EF, Lory S, Stackebrandt E (eds.), "La familia Burkholderiaceae", Los procariotas: Alphaproteobacteria y Betaproteobacteria , Berlín, Heidelberg: Springer, págs. 759–776, doi :10.1007/978-3-642-30197-1_239, ISBN 978-3-642-30197-1, consultado el 18 de abril de 2024
  38. ^ Wakai S, Masanari M, Ikeda T, Yamaguchi N, Ueshima S, Watanabe K, et al. (abril de 2013). "Fosforilación oxidativa en un quimioautótrofo termófilo y facultativo, Hydrogenophilus thermoluteolus, que vive predominantemente en nichos geotérmicos". Informes de microbiología ambiental . 5 (2): 235–242. Bibcode :2013EnvMR...5..235W. doi :10.1111/1758-2229.12005. ISSN  1758-2229. PMID  23584967.
  39. ^ Orlygsson J, Kristjansson JK (2014), Rosenberg E, DeLong EF, Lory S, Stackebrandt E (eds.), "La familia Hydrogenophilaceae", Los procariotas: Alphaproteobacteria y Betaproteobacteria , Berlín, Heidelberg: Springer, págs. 859–868, doi :10.1007/978-3-642-30197-1_244, ISBN 978-3-642-30197-1, consultado el 18 de abril de 2024
  40. ^ McAllister SM, Moore RM, Gartman A, Luther GW, Emerson D, Chan CS (2019). "Las Zetaproteobacteria oxidantes de Fe(II): perspectivas históricas, ecológicas y genómicas". FEMS Microbiology Ecology . 95 (4). doi :10.1093/femsec/fiz015. PMC 6443915 . PMID  30715272 . Consultado el 18 de abril de 2024 . 
  41. ^ Moreira AP, Meirelles PM, Thompson F (2014), Rosenberg E, DeLong EF, Lory S, Stackebrandt E (eds.), "La familia Mariprofundaceae", Los procariotas: Deltaproteobacteria y Epsilonproteobacteria , Berlín, Heidelberg: Springer, págs. 403–413, doi :10.1007/978-3-642-39044-9_378, ISBN 978-3-642-39044-9, consultado el 18 de abril de 2024
  42. ^ Johnston C, Martin B, Fichant G, Polard P, Claverys JP (marzo de 2014). "Transformación bacteriana: distribución, mecanismos compartidos y control divergente". Nature Reviews. Microbiología . 12 (3): 181–196. doi :10.1038/nrmicro3199. PMID  24509783. S2CID  23559881.
  43. ^ Johnsborg O, Eldholm V, Håvarstein LS (diciembre de 2007). "Transformación genética natural: prevalencia, mecanismos y función". Investigación en microbiología . 158 (10): 767–778. doi : 10.1016/j.resmic.2007.09.004 . PMID  17997281.
  44. ^ ab Michod RE, Bernstein H, Nedelcu AM (mayo de 2008). "Valor adaptativo del sexo en patógenos microbianos". Infección, genética y evolución . 8 (3): 267–285. Bibcode :2008InfGE...8..267M. doi :10.1016/j.meegid.2008.01.002. PMID  18295550.
  45. ^ ab Leão I, de Carvalho TB, Henriques V, Ferreira C, Sampaio-Maia B, Manaia CM (febrero de 2023). "Pseudomonadota en la cavidad bucal: un vistazo al nexo entre el medio ambiente y el ser humano". Microbiología y Biotecnología Aplicadas . 107 (2–3): 517–534. doi :10.1007/s00253-022-12333-y. PMC 9842593 . PMID  36567346. 
  46. ^ Williams KP, Kelly DP (agosto de 2013). "Propuesta para una nueva clase dentro del filo Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., con el orden tipo Acidithiobacillales, y descripción enmendada de la clase Gammaproteobacteria". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 63 (parte 8): 2901–2906. doi :10.1099/ijs.0.049270-0. PMID  23334881.
  47. ^ ab Boden R, Hutt LP, Rae AW (mayo de 2017). "Reclasificación de Thiobacillus aquaesulis (Wood y Kelly, 1995) como Annwoodia aquaesulis gen. nov., comb. nov., transferencia de Thiobacillus (Beijerinck, 1904) de Hydrogenophilales a Nitrosomonadales, propuesta de clase Hydrogenophilalia. nov. dentro de 'Proteobacteria', y cuatro nuevas familias dentro de los órdenes Nitrosomonadales y Rhodocyclales". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 67 (5): 1191–1205. doi :10.1099/ijsem.0.001927. hdl : 10026.1/8740 . PMID  28581923.
  48. ^ Emerson D, Rentz JA, Lilburn TG, Davis RE, Aldrich H, Chan C, et al. (agosto de 2007). "Un nuevo linaje de proteobacterias implicadas en la formación de comunidades de tapetes microbianos oxidantes de Fe marinos". PLOS ONE . ​​2 (7): e667. Bibcode :2007PLoSO...2..667E. doi : 10.1371/journal.pone.0000667 . PMC 1930151 . PMID  17668050. 
  49. ^ García-Serquén AL, Chumbe-Nolasco LD, Navarrete AA, Girón-Aguilar RC, Gutiérrez-Reynoso DL (17 de febrero de 2024). "Los sistemas tradicionales de labranza de papa en los Andes peruanos impactan la diversidad bacteriana, la uniformidad, la composición de la comunidad y las funciones en los microbiomas del suelo". Scientific Reports . 14 (1): 3963. Bibcode :2024NatSR..14.3963G. doi :10.1038/s41598-024-54652-2. ISSN  2045-2322. PMC 10874408 . PMID  38368478. 
  50. ^ Michail S, Lin M, Frey MR, Fanter R, Paliy O, Hilbush B, et al. (febrero de 2015). "Alteración de la energía y el metabolismo microbianos intestinales en niños con enfermedad del hígado graso no alcohólico". FEMS Microbiology Ecology . 91 (2): 1–9. doi : 10.1093/femsec/fiu002 . PMC 4358749 . PMID  25764541. 
  51. ^ abc Jia G, Zhi A, Lai PF, Wang G, Xia Y, Xiong Z, et al. (Marzo de 2018). "La microbiota oral: un papel mecanicista de las enfermedades sistémicas". Revista dental británica . 224 (6): 447–455. doi : 10.1038/sj.bdj.2018.217 . PMID  29569607.
  52. ^ abcd García-Serquén AL, Chumbe-Nolasco LD, Navarrete AA, Girón-Aguilar RC, Gutiérrez-Reynoso DL (17 de febrero de 2024). "Los sistemas tradicionales de labranza de papa en los Andes peruanos impactan la diversidad bacteriana, la uniformidad, la composición de la comunidad y las funciones en los microbiomas del suelo". Scientific Reports . 14 (1): 3963. Bibcode :2024NatSR..14.3963G. doi :10.1038/s41598-024-54652-2. ISSN  2045-2322. PMC 10874408 . PMID  38368478. 
  53. ^ Hartman K, Schmid MW, Bodenhausen N, Bender SF, Valzano-Held AY, Schlaeppi K, et al. (31 de julio de 2023). "Una huella simbiótica en el microbioma de la raíz de la planta". Microbioma ambiental . 18 (1): 65. Bibcode :2023EMicb..18...65H. doi : 10.1186/s40793-023-00521-w . ISSN  2524-6372. PMC 10391997 . PMID  37525294. 
  54. ^ Mozumdar L, Mozumdar L (2012). "Productividad agrícola y seguridad alimentaria en el mundo en desarrollo". Bangladesh Journal of Agricultural Economics . 35 . doi :10.22004/AG.ECON.196764.
  55. ^ Bosecker K (julio de 1997). "Biolixiviación: solubilización de metales por microorganismos". FEMS Microbiology Reviews . 20 (3–4): 591–604. doi :10.1111/j.1574-6976.1997.tb00340.x.
  56. ^ abcde Gupta A, Gupta R, Singh RL (2017), Singh RL (ed.), "Microbios y medio ambiente", Principios y aplicaciones de la biotecnología ambiental para un futuro sostenible , Singapur: Springer Singapore: 43–84, doi :10.1007/978-981-10-1866-4_3, ISBN 978-981-10-1865-7, Número de pedido mínimo  7189961
  57. ^ ab Mapelli F, Mengoni A, Riva V, Borin S (enero de 2023). "El cultivo bacteriano es crucial para impulsar la agricultura sostenible". Tendencias en microbiología . 31 (1): 1–4. doi :10.1016/j.tim.2022.10.005. hdl : 2434/945499 .

Enlaces externos

Wikispecies tiene información relacionada con Pseudomonadota .