stringtranslate.com

Proyecto Microbioma Humano

El Proyecto del Microbioma Humano ( HMP , por sus siglas en inglés) fue una iniciativa de investigación de los Institutos Nacionales de Salud (NIH, por sus siglas en inglés) de los Estados Unidos para mejorar la comprensión de la microbiota involucrada en la salud y la enfermedad humanas. Lanzada en 2007, [1] la primera fase (HMP1) se centró en identificar y caracterizar la microbiota humana. La segunda fase, conocida como el Proyecto Integrativo del Microbioma Humano (iHMP, por sus siglas en inglés) se lanzó en 2014 con el objetivo de generar recursos para caracterizar el microbioma y dilucidar los roles de los microbios en los estados de salud y enfermedad. El programa recibió $170 millones en financiación del Fondo Común de los NIH entre 2007 y 2016. [2]

Los componentes importantes del HMP fueron los métodos independientes del cultivo para caracterizar la comunidad microbiana , como la metagenómica (que proporciona una perspectiva genética amplia sobre una única comunidad microbiana), así como la secuenciación extensiva del genoma completo (que proporciona una perspectiva genética "profunda" sobre ciertos aspectos de una comunidad microbiana dada, es decir , de especies bacterianas individuales). Esta última sirvió como secuencias genómicas de referencia (actualmente se planean 3000 secuencias de este tipo de aislados bacterianos individuales ) para fines de comparación durante el análisis metagenómico posterior. El proyecto también financió la secuenciación profunda de secuencias de ARNr 16S bacterianas amplificadas por reacción en cadena de la polimerasa a partir de sujetos humanos. [3]

Introducción

Representación de la prevalencia de varias clases de bacterias en sitios seleccionados de la piel humana

Antes del lanzamiento del HMP, se informaba a menudo en los medios populares y la literatura científica que hay aproximadamente 10 veces más células microbianas y 100 veces más genes microbianos en el cuerpo humano que células humanas; esta cifra se basaba en estimaciones de que el microbioma humano incluye alrededor de 100 billones de células bacterianas y un humano adulto normalmente tiene alrededor de 10 billones de células humanas. [4] En 2014, la Academia Estadounidense de Microbiología publicó una sección de preguntas frecuentes que enfatizaba que la cantidad de células microbianas y la cantidad de células humanas son ambas estimaciones, y señaló que una investigación reciente había llegado a una nueva estimación de la cantidad de células humanas en alrededor de 37 billones de células, lo que significa que la proporción de células microbianas a humanas es probablemente de aproximadamente 3:1. [4] [5] En 2016, otro grupo publicó una nueva estimación de la proporción de aproximadamente 1:1 (1,3:1, con "una incertidumbre del 25% y una variación del 53% sobre la población de machos estándar de 70 kg"). [6] [7]

A pesar de la asombrosa cantidad de microbios dentro y sobre el cuerpo humano, se sabía poco sobre sus funciones en la salud y la enfermedad humanas. Muchos de los organismos que componen el microbioma no se han cultivado , identificado o caracterizado de otra manera con éxito. Sin embargo, los organismos que se cree que se encuentran en el microbioma humano pueden clasificarse generalmente como bacterias , miembros del dominio Archaea , levaduras y eucariotas unicelulares , así como varios parásitos helmintos y virus , estos últimos incluyen virus que infectan a los organismos del microbioma celular (p. ej., bacteriófagos ). El HMP se propuso descubrir y caracterizar el microbioma humano, enfatizando los sitios oral, cutáneo, vaginal, gastrointestinal y respiratorio.

El HMP abordará algunas de las cuestiones científicas más inspiradoras, desconcertantes y fundamentales de la actualidad. Es importante destacar que también tiene el potencial de derribar las barreras artificiales entre la microbiología médica y la microbiología ambiental. Se espera que el HMP no solo identifique nuevas formas de determinar la salud y la predisposición a las enfermedades, sino que también defina los parámetros necesarios para diseñar, implementar y monitorear estrategias para manipular intencionalmente la microbiota humana, a fin de optimizar su desempeño en el contexto de la fisiología de un individuo. [8]

El HMP ha sido descrito como "una extensión conceptual y experimental lógica del Proyecto Genoma Humano ". [8] En 2007, el HMP fue incluido en la Hoja de Ruta para la Investigación Médica del NIH [9] como una de las Nuevas Vías para el Descubrimiento . La caracterización organizada del microbioma humano también se está realizando a nivel internacional bajo los auspicios del Consorcio Internacional del Microbioma Humano. [10] Los Institutos Canadienses de Investigación en Salud , a través del Instituto de Infecciones e Inmunidad de los CIHR, están liderando la Iniciativa Canadiense del Microbioma para desarrollar un esfuerzo de investigación coordinado y enfocado para analizar y caracterizar los microbios que colonizan el cuerpo humano y su posible alteración durante los estados de enfermedad crónica. [11]

Instituciones contribuyentes

El HMP contó con la participación de muchas instituciones de investigación, entre ellas la Universidad de Stanford , el Broad Institute , la Virginia Commonwealth University , la Washington University , la Northeastern University , el MIT , el Baylor College of Medicine y muchas otras. Las contribuciones incluyeron la evaluación de datos, la construcción de conjuntos de datos de secuencias de referencia, estudios éticos y legales, desarrollo de tecnología y más. [ cita requerida ]

Primera fase (2007-2014)

El HMP1 incluyó esfuerzos de investigación de muchas instituciones. [12] El HMP1 estableció los siguientes objetivos: [13]

Segunda fase (2014-2016)

En 2014, el NIH lanzó la segunda fase del proyecto, conocida como Proyecto Integrativo del Microbioma Humano (iHMP). El objetivo del iHMP era producir recursos para crear una caracterización completa del microbioma humano, con un enfoque en la comprensión de la presencia de la microbiota en estados de salud y enfermedad. [14] La misión del proyecto, según lo establecido por el NIH, era la siguiente:

El iHMP creará conjuntos de datos longitudinales integrados de propiedades biológicas tanto del microbioma como del huésped a partir de tres estudios de cohorte diferentes de condiciones asociadas al microbioma utilizando múltiples tecnologías "ómicas". [14]

El proyecto abarcó tres subproyectos llevados a cabo en varias instituciones. Los métodos de estudio incluyeron el perfil genético del ARNr 16S , la secuenciación shotgun del metagenoma completo , la secuenciación del genoma completo , la metatranscriptómica , la metabolómica / lipidómica y la inmunoproteómica . Los hallazgos clave del iHMP se publicaron en 2019. [15]

Embarazo y parto prematuro

El equipo del Consorcio del Microbioma Vaginal de la Universidad Commonwealth de Virginia dirigió la investigación del proyecto Embarazo y Nacimiento Prematuro con el objetivo de comprender cómo cambia el microbioma durante el período gestacional e influye en el microbioma neonatal. El proyecto también se ocupó del papel del microbioma en la aparición de nacimientos prematuros, que, según los CDC , representan casi el 10% de todos los nacimientos [16] y constituyen la segunda causa principal de muerte neonatal. [17] El proyecto recibió $7,44 millones en financiación del NIH. [18]

Aparición de la enfermedad inflamatoria intestinal (EII)

El equipo de Datos Multiómicos de Enfermedad Inflamatoria Intestinal (IBDMDB) fue un grupo de investigadores de varias instituciones enfocado en comprender cómo cambia longitudinalmente el microbioma intestinal en adultos y niños que padecen EII . La EII es un trastorno autoinmune inflamatorio que se manifiesta como enfermedad de Crohn o colitis ulcerosa y afecta a aproximadamente un millón de estadounidenses. [19] Los participantes de la investigación incluyeron cohortes del Hospital General de Massachusetts , el Hospital Universitario Emory / Hospital Infantil de Cincinnati y el Centro Médico Cedars-Sinai . [20]

Aparición de la diabetes tipo 2 (DT2)

Investigadores de la Universidad de Stanford y del Laboratorio Jackson de Medicina Genómica trabajaron juntos para realizar un análisis longitudinal sobre los procesos biológicos que ocurren en el microbioma de pacientes con riesgo de diabetes tipo 2. La diabetes tipo 2 afecta a casi 20 millones de estadounidenses con al menos 79 millones de pacientes prediabéticos [21] y se caracteriza parcialmente por cambios marcados en el microbioma en comparación con los individuos sanos. El proyecto tuvo como objetivo identificar moléculas y vías de señalización que desempeñan un papel en la etiología de la enfermedad [22] .

Logros

El impacto del HMP hasta la fecha se puede evaluar parcialmente mediante el examen de las investigaciones patrocinadas por el HMP. Más de 650 publicaciones revisadas por pares se incluyeron en el sitio web del HMP desde junio de 2009 hasta fines de 2017, y se habían citado más de 70 000 veces. [23] En ese momento, el sitio web se archivó y ya no se actualiza, aunque los conjuntos de datos continúan estando disponibles. [24]

Las principales categorías de trabajo financiadas por HMP incluyeron:

Los desarrollos financiados por HMP incluyeron:

Hitos

Se estableció una base de datos de referencia

El 13 de junio de 2012, el director del NIH, Francis Collins, anunció un hito importante del HMP . [51] El anuncio estuvo acompañado de una serie de artículos coordinados publicados en Nature [52] [53] y varias revistas, incluida la Biblioteca Pública de Ciencias (PLoS), el mismo día. [54] [55] [56] Al mapear la composición microbiana normal de humanos sanos utilizando técnicas de secuenciación del genoma, los investigadores del HMP han creado una base de datos de referencia y los límites de la variación microbiana normal en humanos. [57]

De 242 voluntarios sanos de Estados Unidos, se recogieron más de 5.000 muestras de tejidos de 15 (hombres) a 18 (mujeres) partes del cuerpo, como boca, nariz, piel, intestino grueso (heces) y vagina. Todo el ADN, humano y microbiano, se analizó con máquinas de secuenciación de ADN. Los datos del genoma microbiano se extrajeron identificando el ARN ribosómico específico de las bacterias, el ARNr 16S . Los investigadores calcularon que más de 10.000 especies microbianas ocupan el ecosistema humano y han identificado entre el 81 y el 99% de los géneros . Además de establecer la base de datos de referencia del microbioma humano, el proyecto HMP también descubrió varias "sorpresas", que incluyen: [ cita requerida ]

Aplicación clínica

Entre las primeras aplicaciones clínicas que utilizaron los datos del HMP, como se informó en varios artículos de PLoS, los investigadores encontraron un cambio hacia una menor diversidad de especies en el microbioma vaginal de las mujeres embarazadas en preparación para el parto, y una alta carga de ADN viral en el microbioma nasal de los niños con fiebres inexplicables. Otros estudios que utilizan los datos y técnicas del HMP incluyen el papel del microbioma en varias enfermedades del tracto digestivo, la piel, los órganos reproductivos y los trastornos infantiles. [51]

Aplicación farmacéutica

Los microbiólogos farmacéuticos han considerado las implicaciones de los datos del HMP en relación con la presencia/ausencia de microorganismos "objetables" en productos farmacéuticos no estériles y en relación con el monitoreo de microorganismos dentro de los entornos controlados en los que se fabrican los productos. Esto último también tiene implicaciones para la selección de medios y los estudios de eficacia de los desinfectantes. [58]

Véase también

Referencias

  1. ^ "Proyecto del microbioma humano: la diversidad de microbios humanos es mayor de lo previsto anteriormente". ScienceDaily . Consultado el 8 de marzo de 2012 .
  2. ^ "Proyecto del microbioma humano - Página de inicio | Fondo común de los NIH". commonfund.nih.gov . 28 de junio de 2013 . Consultado el 15 de abril de 2018 .
  3. ^ "Proyecto del microbioma humano". Fondo común del NIH . Consultado el 8 de marzo de 2012 .
  4. ^ ab Preguntas frecuentes de la Academia Estadounidense de Microbiología: microbioma humano Archivado el 31 de diciembre de 2016 en Wayback Machine . Enero de 2014
  5. ^ Judah L. Rosner para Microbe Magazine, febrero de 2014. ¿Diez veces más células microbianas que células corporales en los humanos?
  6. ^ Alison Abbott para Nature News. 8 de enero de 2016 Los científicos desmienten el mito de que nuestros cuerpos tienen más bacterias que células humanas
  7. ^ Sender R, Fuchs S, Milo R (enero de 2016). "¿Realmente nos superan ampliamente en número? Revisando la proporción de células bacterianas y células huésped en humanos". Cell . 164 (3): 337–40. doi : 10.1016/j.cell.2016.01.013 . PMID  26824647.
  8. ^ ab Turnbaugh PJ, Ley RE, Hamady M, Fraser-Liggett CM, Knight R, Gordon JI (octubre de 2007). "El proyecto del microbioma humano". Nature . 449 (7164): 804–10. Bibcode :2007Natur.449..804T. doi :10.1038/nature06244. PMC 3709439 . PMID  17943116. 
  9. ^ "Acerca de la hoja de ruta del NIH". Fondo Común del NIH. Archivado desde el original el 17 de febrero de 2013. Consultado el 8 de marzo de 2012 .
  10. ^ "El Consorcio Internacional del Microbioma Humano" . Consultado el 8 de marzo de 2012 .
  11. ^ "Iniciativa canadiense sobre el microbioma". Institutos canadienses de investigación sanitaria. 13 de agosto de 2009. Consultado el 8 de marzo de 2012 .
  12. ^ "Proyecto del microbioma humano / Investigación financiada". Fondo común del NIH . Consultado el 8 de marzo de 2012 .
  13. ^ "Proyecto/iniciativas programáticas sobre el microbioma humano". Fondo común de los NIH. Archivado desde el original el 16 de noviembre de 2013. Consultado el 8 de marzo de 2012 .
  14. ^ ab "Proyecto del microbioma humano del NIH: acerca del microbioma humano". hmpdacc.org . Consultado el 30 de marzo de 2018 .
  15. ^ Equipo de análisis de cartera del microbioma humano del NIH (2019). "Una revisión de 10 años de actividades de investigación del microbioma humano en los Institutos Nacionales de Salud de EE. UU., años fiscales 2007-2016". Microbioma . 7 (1): 31. doi : 10.1186/s40168-019-0620-y . ISSN  2049-2618. PMC 6391833 . PMID  30808411. 
  16. ^ Ferré C, Callaghan W, Olson C, Sharma A, Barfield W (noviembre de 2016). "Efectos de la edad materna y las tasas de nacimientos prematuros específicas por edad en las tasas generales de nacimientos prematuros - Estados Unidos, 2007 y 2014". MMWR. Informe semanal de morbilidad y mortalidad . 65 (43): 1181–1184. doi : 10.15585/mmwr.mm6543a1 . PMID  27811841.
  17. ^ "Mortalidad infantil | Salud materna e infantil | Salud reproductiva | CDC". www.cdc.gov . 2018-01-02 . Consultado el 2018-04-03 .
  18. ^ Consorcio, VCU, Microbioma vaginal. "Consorcio del microbioma vaginal". vmc.vcu.edu . Consultado el 5 de abril de 2018 .{{cite web}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  19. ^ "CDC - Epidemiología de la EII - Enfermedad inflamatoria intestinal". www.cdc.gov . Archivado desde el original el 23 de febrero de 2017 . Consultado el 15 de abril de 2018 .
  20. ^ "Equipo". ibdmdb.org . Consultado el 5 de abril de 2018 .
  21. ^ "Informe nacional sobre estadísticas de diabetes | Datos y estadísticas | Diabetes | CDC". www.cdc.gov . 2018-03-09 . Consultado el 2018-04-15 .
  22. ^ "Perfiles ómicos personales integrados | Perfiles ómicos personales integrados | Stanford Medicine". med.stanford.edu . Consultado el 5 de abril de 2018 .
  23. ^ "Proyecto del microbioma humano - Página de inicio | Fondo común de los NIH". commonfund.nih.gov . 28 de junio de 2013 . Consultado el 18 de abril de 2019 .
  24. ^ "Portal de datos del proyecto del microbioma humano". portal.hmpdacc.org . Consultado el 18 de abril de 2019 .
  25. ^ Markowitz VM, Chen IM, Palaniappan K, Chu K, Szeto E, Grechkin Y, Ratner A, Jacob B, Huang J, Williams P, Huntemann M, Anderson I, Mavromatis K, Ivanova NN, Kyrpides NC (enero de 2012). "IMG: la base de datos de genomas microbianos integrados y sistema de análisis comparativo". Nucleic Acids Research . 40 (número de la base de datos): D115–22. doi :10.1093/nar/gkr1044. PMC 3245086 . PMID  22194640. 
  26. ^ Markowitz VM, Chen IM, Chu K, Szeto E, Palaniappan K, Grechkin Y, Ratner A, Jacob B, Pati A, Huntemann M, Liolios K, Pagani I, Anderson I, Mavromatis K, Ivanova NN, Kyrpides NC (enero de 2012). "IMG/M: el sistema integrado de análisis comparativo y gestión de datos metagenómicos". Nucleic Acids Research . 40 (número de base de datos): D123–9. doi :10.1093/nar/gkr975. PMC 3245048 . PMID  22086953. 
  27. ^ Madupu R, Richter A, Dodson RJ, Brinkac L, Harkins D, Durkin S, Shrivastava S, Sutton G, Haft D (enero de 2012). "CharProtDB: una base de datos de anotaciones de proteínas caracterizadas experimentalmente". Nucleic Acids Research . 40 (número de la base de datos): D237–41. doi :10.1093/nar/gkr1133. PMC 3245046 . PMID  22140108. 
  28. ^ Pagani I, Liolios K, Jansson J, Chen IM, Smirnova T, Nosrat B, Markowitz VM, Kyrpides NC (enero de 2012). "La base de datos Genomes OnLine (GOLD) v.4: estado de los proyectos genómicos y metagenómicos y sus metadatos asociados". Nucleic Acids Research . 40 (número de la base de datos): D571–9. doi :10.1093/nar/gkr1100. PMC 3245063 . PMID  22135293. 
  29. ^ Zhao Y, Tang H, Ye Y (enero de 2012). "RAPSearch2: una herramienta de búsqueda de similitud de proteínas rápida y eficiente en memoria para datos de secuenciación de próxima generación". Bioinformática . 28 (1): 125–6. doi :10.1093/bioinformatics/btr595. PMC 3244761 . PMID  22039206. 
  30. ^ Stombaugh J, Widmann J, McDonald D, Knight R (junio de 2011). "Boulder ALignment Editor (ALE): una herramienta de alineación de ARN basada en la web". Bioinformática . 27 (12): 1706–7. doi :10.1093/bioinformatics/btr258. PMC 3106197 . PMID  21546392. 
  31. ^ Wu S, Zhu Z, Fu L, Niu B, Li W (septiembre de 2011). "WebMGA: un servidor web personalizable para el análisis rápido de secuencias metagenómicas". BMC Genomics . 12 : 444. doi : 10.1186/1471-2164-12-444 . PMC 3180703 . PMID  21899761. 
  32. ^ Ghodsi M, Liu B, Pop M (junio de 2011). "DNACLUST: agrupamiento preciso y eficiente de genes marcadores filogenéticos". BMC Bioinformatics . 12 : 271. doi : 10.1186/1471-2105-12-271 . PMC 3213679 . PMID  21718538. 
  33. ^ Yao G, Ye L, Gao H, Minx P, Warren WC, Weinstock GM (enero de 2012). "Graph accord of next-generation sequence assemblies" (Conformidad gráfica de los ensamblajes de secuencias de próxima generación). Bioinformática . 28 (1): 13–6. doi :10.1093/bioinformatics/btr588. PMC 3244760 . PMID  22025481. 
  34. ^ Treangen TJ, Sommer DD, Angly FE, Koren S, Pop M (marzo de 2011). Ensamblaje de secuencias de próxima generación con AMOS . Vol. Capítulo 11. págs. Unidad 11.8. doi :10.1002/0471250953.bi1108s33. ISBN 978-0471250951. PMC  3072823 . PMID  21400694. {{cite book}}: |journal=ignorado ( ayuda )
  35. ^ Koren S, Miller JR, Walenz BP, Sutton G (septiembre de 2010). "Un algoritmo para el cierre automatizado durante el ensamblaje". BMC Bioinformatics . 11 : 457. doi : 10.1186/1471-2105-11-457 . PMC 2945939 . PMID  20831800. 
  36. ^ "Proyecto del microbioma humano/Datos de referencia sobre genomas". Centro de análisis y coordinación de datos (DACC) de los Institutos Nacionales de Salud (NIH) . Consultado el 8 de marzo de 2012 .
  37. ^ "Centro de análisis y coordinación de datos (DACC)". Fondo común de los Institutos Nacionales de Salud (NIH) . Consultado el 11 de marzo de 2012 .
  38. ^ Schwab AP, Frank L, Gligorov N (noviembre de 2011). "Decir privacidad significa confidencialidad". The American Journal of Bioethics . 11 (11): 44–5. doi :10.1080/15265161.2011.608243. PMID  22047127. S2CID  34313782.
  39. ^ Rhodes R, Azzouni J, Baumrin SB, Benkov K, Blaser MJ, Brenner B, Dauben JW, Earle WJ, Frank L, Gligorov N, Goldfarb J, Hirschhorn K, Hirschhorn R, Holzman I, Indyk D, Jabs EW, Lackey DP, Moros DA, Philpott S, Rhodes ME, Richardson LD, Sacks HS, Schwab A, Sperling R, Trusko B, Zweig A (noviembre de 2011). "Riesgo de minimis: una propuesta para una nueva categoría de riesgo de investigación". The American Journal of Bioethics . 11 (11): 1–7. doi :10.1080/15265161.2011.615588. PMID  22047112. S2CID  205859554.
  40. ^ McGuire AL, Lupski JR (mayo de 2010). "Investigación sobre el genoma personal: ¿qué se le debe decir al participante?". Tendencias en genética . 26 (5): 199–201. doi :10.1016/j.tig.2009.12.007. PMC 2868334. PMID  20381895 . 
  41. ^ Sharp RR, Achkar JP, Brinich MA, Farrell RM (abril de 2009). "Ayudar a los pacientes a tomar decisiones informadas sobre los probióticos: una necesidad de investigación". The American Journal of Gastroenterology . 104 (4): 809–13. doi :10.1038/ajg.2008.68. PMC 2746707 . PMID  19343022. 
  42. ^ Cuellar-Partida G, Buske FA, McLeay RC, Whitington T, Noble WS, Bailey TL (enero de 2012). "Prioridades epigenéticas para identificar sitios de unión de factores de transcripción activos". Bioinformática . 28 (1): 56–62. doi :10.1093/bioinformatics/btr614. PMC 3244768 . PMID  22072382. 
  43. ^ Haft DH (enero de 2011). "Evidencia bioinformática de un precursor transportador de electrones ampliamente distribuido y producido por ribosomas, sus proteínas de maduración y sus socios redox nicotinoproteínas". BMC Genomics . 12 : 21. doi : 10.1186/1471-2164-12-21 . PMC 3023750 . PMID  21223593. 
  44. ^ Caporaso JG, Lauber CL, Costello EK, Berg-Lyons D, Gonzalez A, Stombaugh J, Knights D, Gajer P, Ravel J, Fierer N, Gordon JI, Knight R (2011). "Imágenes en movimiento del microbioma humano". Genome Biology . 12 (5): R50. doi : 10.1186/gb-2011-12-5-r50 . PMC 3271711 . PMID  21624126. 
  45. ^ Sczesnak A, Segata N, Qin X, Gevers D, Petrosino JF, Huttenhower C, Littman DR, Ivanov II (septiembre de 2011). "El genoma de las bacterias filamentosas segmentadas que inducen la producción de células th17 revela una amplia auxotrofia y adaptaciones al entorno intestinal". Cell Host & Microbe . 10 (3): 260–72. doi :10.1016/j.chom.2011.08.005. PMC 3209701 . PMID  21925113. 
  46. ^ Ballal SA, Gallini CA, Segata N, Huttenhower C, Garrett WS (abril de 2011). "Factores simbióticos de la microbiota intestinal y del huésped: lecciones de la enfermedad inflamatoria intestinal y simbiontes exitosos". Microbiología celular . 13 (4): 508–17. doi :10.1111/j.1462-5822.2011.01572.x. PMID  21314883. S2CID  205529660.
  47. ^ Bergmann GT, Bates ST, Eilers KG, Lauber CL, Caporaso JG, Walters WA, Knight R, Fierer N (julio de 2011). "El predominio poco reconocido de Verrucomicrobia en las comunidades bacterianas del suelo". Soil Biology & Biochemistry . 43 (7): 1450–1455. doi :10.1016/j.soilbio.2011.03.012. PMC 3260529 . PMID  22267877. 
  48. ^ Yeoman CJ, Yildirim S, Thomas SM, Durkin AS, Torralba M, Sutton G, Buhay CJ, Ding Y, Dugan-Rocha SP, Muzny DM, Qin X, Gibbs RA, Leigh SR, Stumpf R, White BA, Highlander SK, Nelson KE, Wilson BA (agosto de 2010). Li W (ed.). "La genómica comparativa de las cepas de Gardnerella vaginalis revela diferencias sustanciales en el potencial metabólico y de virulencia". PLOS ONE . ​​5 (8): e12411. Bibcode :2010PLoSO...512411Y. doi : 10.1371/journal.pone.0012411 . PMC 2928729 . PMID  20865041. 
  49. ^ Koren O, Spor A, Felin J, Fåk F, Stombaugh J, Tremaroli V, Behre CJ, Knight R, Fagerberg B, Ley RE, Bäckhed F (marzo de 2011). "Microbiota oral, intestinal y de placa humana en pacientes con aterosclerosis". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 108 Suppl 1 (Suplemento_1): 4592–8. Bibcode :2011PNAS..108.4592K. doi : 10.1073/pnas.1011383107 . PMC 3063583 . PMID  20937873. 
  50. ^ Marri PR, Paniscus M, Weyand NJ, Rendón MA, Calton CM, Hernández DR, Higashi DL, Sodergren E, Weinstock GM, Rounsley SD, So M (julio de 2010). Ahmed N (ed.). "La secuenciación del genoma revela un intercambio generalizado de genes de virulencia entre las especies humanas de Neisseria". PLOS ONE . ​​5 (7): e11835. Bibcode :2010PLoSO...511835M. doi : 10.1371/journal.pone.0011835 . PMC 2911385 . PMID  20676376. 
  51. ^ ab "El proyecto del microbioma humano del NIH define la composición bacteriana normal del cuerpo". Noticias del NIH. 13 de junio de 2012.
  52. ^ Consorcio del Proyecto del Microbioma Humano (junio de 2012). "Un marco para la investigación del microbioma humano". Nature . 486 (7402): 215–21. Bibcode :2012Natur.486..215T. doi :10.1038/nature11209. PMC 3377744 . PMID  22699610. 
  53. ^ Consorcio del Proyecto del Microbioma Humano (junio de 2012). «Estructura, función y diversidad del microbioma humano saludable». Nature . 486 (7402): 207–14. Bibcode :2012Natur.486..207T. doi :10.1038/nature11234. PMC 3564958 . PMID  22699609. 
  54. ^ Cantarel BL, Lombard V, Henrissat B (2012). "Utilización de carbohidratos complejos por el microbioma humano saludable". PLOS ONE . ​​7 (6): e28742. Bibcode :2012PLoSO...728742C. doi : 10.1371/journal.pone.0028742 . PMC 3374616 . PMID  22719820. 
  55. ^ Wu YW, Rho M, Doak TG, Ye Y (agosto de 2012). "Las espiroquetas orales implicadas en enfermedades dentales están muy extendidas en sujetos humanos normales y portan casetes de genes integrones extremadamente diversos". Applied and Environmental Microbiology . 78 (15): 5288–96. Bibcode :2012ApEnM..78.5288W. doi :10.1128/AEM.00564-12. PMC 3416431 . PMID  22635997. 
  56. ^ "Colecciones PLOS: colecciones de artículos publicadas por la Biblioteca Pública de Ciencias". collections.plos.org . Consultado el 15 de abril de 2018 .
  57. ^ "Resúmenes de manuscritos" (PDF) . Archivado desde el original (PDF) el 4 de marzo de 2014. Consultado el 6 de noviembre de 2012 .
  58. ^ Wilder, C, Sandle T, Sutton S (junio de 2013). "Implicaciones del microbioma humano en la microbiología farmacéutica". American Pharmaceutical Review .

Enlaces externos