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Evolución de la complejidad biológica.

La evolución de la complejidad biológica es un resultado importante del proceso de evolución . [1] La evolución ha producido algunos organismos notablemente complejos, aunque el nivel real de complejidad es muy difícil de definir o medir con precisión en biología, con propiedades como el contenido genético, el número de tipos de células o la morfología propuestas como posibles métricas. [2] [3] [4]

Muchos biólogos solían creer que la evolución era progresiva (ortogénesis) y tenía una dirección que conducía hacia los llamados "organismos superiores", a pesar de la falta de evidencia para este punto de vista. [5] Esta idea de "progresión" introdujo los términos " animales superiores " y " animales inferiores " en la evolución. Muchos ahora consideran que esto es engañoso, ya que la selección natural no tiene una dirección intrínseca y los organismos seleccionan para aumentar o disminuir la complejidad en respuesta a las condiciones ambientales locales. [6] Aunque ha habido un aumento en el nivel máximo de complejidad a lo largo de la historia de la vida , siempre ha habido una gran mayoría de organismos pequeños y simples y el nivel de complejidad más común parece haber permanecido relativamente constante.

Selección por simplicidad y complejidad.

Por lo general, los organismos que tienen una tasa de reproducción más alta que sus competidores tienen una ventaja evolutiva. En consecuencia, los organismos pueden evolucionar para volverse más simples y así multiplicarse más rápido y producir más descendencia, ya que requieren menos recursos para reproducirse. Un buen ejemplo son parásitos como el Plasmodium –el parásito responsable de la malaria– y el micoplasma ; Estos organismos a menudo prescinden de rasgos que se vuelven innecesarios a través del parasitismo en un huésped. [7]

Un linaje también puede prescindir de la complejidad cuando un rasgo complejo particular simplemente no proporciona ninguna ventaja selectiva en un entorno particular. La pérdida de este rasgo no necesariamente confiere una ventaja selectiva, pero puede perderse debido a la acumulación de mutaciones si su pérdida no confiere una desventaja selectiva inmediata. [8] Por ejemplo, un organismo parásito puede prescindir de la vía sintética de un metabolito donde puede eliminar fácilmente ese metabolito de su huésped. Descartar esta síntesis puede no necesariamente permitir que el parásito conserve una cantidad significativa de energía o recursos y crezca más rápido, pero la pérdida puede corregirse en la población mediante la acumulación de mutaciones si no se incurre en ninguna desventaja por la pérdida de esa vía. Las mutaciones que causan la pérdida de un rasgo complejo ocurren con más frecuencia que las mutaciones que causan la ganancia de un rasgo complejo. [ cita necesaria ]

Con la selección, la evolución también puede producir organismos más complejos. La complejidad a menudo surge en la coevolución de huéspedes y patógenos, [9] y cada lado desarrolla adaptaciones cada vez más sofisticadas, como el sistema inmunológico y las muchas técnicas que los patógenos han desarrollado para evadirlo. Por ejemplo, el parásito Trypanosoma brucei , que causa la enfermedad del sueño , ha desarrollado tantas copias de su principal antígeno de superficie que alrededor del 10% de su genoma está dedicado a diferentes versiones de este gen. Esta tremenda complejidad permite al parásito cambiar constantemente su superficie y así evadir el sistema inmunológico mediante variación antigénica . [10]

De manera más general, el crecimiento de la complejidad puede estar impulsado por la coevolución entre un organismo y el ecosistema de depredadores , presas y parásitos a los que intenta adaptarse: a medida que cualquiera de estos se vuelve más complejo para afrontar mejor la diversidad de las amenazas que ofrece el ecosistema formado por los demás, los demás también tendrán que adaptarse volviéndose más complejos, desencadenando así una carrera armamentista evolutiva en curso [9] hacia una mayor complejidad. [11] Esta tendencia puede verse reforzada por el hecho de que los ecosistemas mismos tienden a volverse más complejos con el tiempo, a medida que aumenta la diversidad de especies , junto con los vínculos o dependencias entre especies.

Tipos de tendencias en complejidad.

Tendencias pasivas versus activas en complejidad. Los organismos al principio son rojos. Los números se muestran por altura y el tiempo avanza en una serie.

Si la evolución poseyera una tendencia activa hacia la complejidad ( ortogénesis ), como se creía ampliamente en el siglo XIX, [12] entonces esperaríamos ver una tendencia activa de aumento con el tiempo en el valor más común (la moda) de complejidad entre los organismos. . [13]

Sin embargo, un aumento de la complejidad también puede explicarse mediante un proceso pasivo. [13] Asumir cambios aleatorios imparciales de complejidad y la existencia de una complejidad mínima conduce a un aumento con el tiempo de la complejidad promedio de la biosfera. Esto implica un aumento de la varianza , pero la moda no cambia. La tendencia a la creación de algunos organismos con mayor complejidad a lo largo del tiempo existe, pero involucra porcentajes cada vez más pequeños de seres vivos. [4]

En esta hipótesis, cualquier apariencia de evolución actuando con una dirección intrínseca hacia organismos cada vez más complejos es el resultado de que las personas se concentran en el pequeño número de organismos grandes y complejos que habitan la cola derecha de la distribución de complejidad e ignoran los más simples y mucho más comunes. organismos. Este modelo pasivo predice que la mayoría de las especies son procariotas microscópicos , lo que está respaldado por estimaciones de 10 6 a 10 9 procariotas existentes [14] en comparación con estimaciones de diversidad de 10 6 a 3,10 6 para eucariotas. [15] [16] En consecuencia, desde este punto de vista, la vida microscópica domina la Tierra, y los organismos grandes solo parecen más diversos debido al sesgo de muestreo .

La complejidad del genoma ha aumentado en general desde el comienzo de la vida en la Tierra. [17] [18] Algunos modelos informáticos han sugerido que la generación de organismos complejos es una característica ineludible de la evolución. [19] [20] Las proteínas tienden a volverse más hidrofóbicas con el tiempo, [21] y a tener sus aminoácidos hidrofóbicos más intercalados a lo largo de la secuencia primaria. [22] A veces se observan aumentos en el tamaño corporal con el tiempo en lo que se conoce como regla de Cope . [23]

Evolución neutral constructiva

Un trabajo reciente en teoría de la evolución ha propuesto que al relajar la presión de selección , que típicamente actúa para racionalizar los genomas , la complejidad de un organismo aumenta mediante un proceso llamado evolución neutral constructiva . [24] Dado que el tamaño efectivo de la población en eucariotas (especialmente organismos multicelulares) es mucho menor que en procariotas, [25] experimentan menores restricciones de selección .

Según este modelo, los nuevos genes se crean mediante procesos no adaptativos , como la duplicación aleatoria de genes . Estas nuevas entidades, aunque no son necesarias para la viabilidad, le dan al organismo un exceso de capacidad que puede facilitar la descomposición mutacional de las subunidades funcionales. Si esta decadencia resulta en una situación en la que ahora se necesitan todos los genes, el organismo ha quedado atrapado en un nuevo estado en el que el número de genes ha aumentado. Este proceso ha sido a veces descrito como un trinquete complejante. [26] Estos genes suplementarios pueden luego ser cooptados por selección natural mediante un proceso llamado neofuncionalización . En otros casos, la evolución neutral constructiva no promueve la creación de nuevas partes, sino que promueve interacciones novedosas entre los actores existentes, que luego asumen nuevos roles de pluriempleo. [26]

La evolución neutra constructiva también se ha utilizado para explicar cómo complejos antiguos, como el espliceosoma y el ribosoma , han ganado nuevas subunidades con el tiempo, cómo surgen nuevas isoformas alternativas de genes empalmados, cómo evolucionó la codificación de genes en los ciliados , cómo ubicó la edición pan- ARN pueden haber surgido en Trypanosoma brucei , cómo los lncRNA funcionales probablemente hayan surgido del ruido transcripcional y cómo incluso los complejos proteicos inútiles pueden persistir durante millones de años. [24] [27] [26] [28] [29] [30] [31]

Hipótesis de riesgo mutacional

La hipótesis del riesgo mutacional es una teoría no adaptativa para una mayor complejidad en los genomas. [32] La base de la hipótesis del riesgo mutacional es que cada mutación del ADN no codificante impone un costo de aptitud. [33] La variación en la complejidad puede describirse mediante 2N e u, donde N e es el tamaño efectivo de la población y u es la tasa de mutación . [34]

En esta hipótesis, la selección contra el ADN no codificante se puede reducir de tres maneras: deriva genética aleatoria, tasa de recombinación y tasa de mutación. [35] A medida que aumenta la complejidad de procariotas a eucariotas multicelulares, el tamaño efectivo de la población disminuye, lo que posteriormente aumenta la fuerza de la deriva genética aleatoria . [32] Esto, junto con una baja tasa de recombinación [35] y una alta tasa de mutación, [35] permite que el ADN no codificante prolifere sin ser eliminado mediante selección purificadora . [32]

La acumulación de ADN no codificante en genomas más grandes se puede observar al comparar el tamaño y el contenido del genoma entre taxones eucariotas. Existe una correlación positiva entre el tamaño del genoma y el contenido del genoma del ADN no codificante y cada grupo se mantiene dentro de alguna variación. [32] [33] Al comparar la variación en la complejidad de los orgánulos, el tamaño efectivo de la población se reemplaza con el tamaño genético efectivo de la población (N g ). [34] Si se analiza la diversidad de nucleótidos del sitio silencioso , se espera que los genomas más grandes tengan menos diversidad que los más compactos. En las mitocondrias de plantas y animales , las diferencias en la tasa de mutación explican direcciones opuestas en complejidad, siendo las mitocondrias de las plantas más complejas y las mitocondrias de los animales más simplificadas. [36]

La hipótesis del riesgo mutacional se ha utilizado para explicar, al menos parcialmente, los genomas expandidos en algunas especies. Por ejemplo, al comparar Volvox cateri con un pariente cercano con un genoma compacto, Chlamydomonas reinhardtii , el primero tenía menos diversidad de sitios silenciosos que el segundo en los genomas nuclear, mitocondrial y de plastidios. [37] Sin embargo, al comparar el genoma de plastidios de Volvox cateri con Volvox africanus , una especie del mismo género pero con la mitad del tamaño del genoma de plastidios, hubo altas tasas de mutación en regiones intergénicas. [38] En Arabiopsis thaliana , la hipótesis se utilizó como una posible explicación para la pérdida de intrones y el tamaño compacto del genoma. En comparación con Arabidopsis lyrata , los investigadores encontraron una tasa de mutación más alta en general y en los intrones perdidos (un intrón que ya no se transcribe ni se empalma) en comparación con los intrones conservados. [39]

Hay genomas expandidos en otras especies que no podrían explicarse mediante la hipótesis del riesgo mutacional. Por ejemplo, los genomas mitocondriales expandidos de Silene noctiflora y Silene conica tienen altas tasas de mutación, menores longitudes de intrones y más elementos de ADN no codificantes en comparación con otros del mismo género, pero no hubo evidencia de un tamaño de población efectivo bajo a largo plazo. . [40] Los genomas mitocondriales de Citrullus lanatus y Cucurbita pepo difieren en varios aspectos. Citrullus lanatus es más pequeño, tiene más intrones y duplicaciones, mientras que Cucurbita pepo es más grande con más cloroplasto y secuencias cortas repetidas. [41] Si los sitios de edición de ARN y la tasa de mutación estuvieran alineados, entonces Cucurbita pepo tendría una tasa de mutación más baja y más sitios de edición de ARN. Sin embargo, la tasa de mutación es cuatro veces mayor que la de Citrullus lanatus y tienen un número similar de sitios de edición de ARN. [41] También hubo un intento de utilizar la hipótesis para explicar los grandes genomas nucleares de las salamandras , pero los investigadores encontraron resultados opuestos a los esperados, incluida una menor fuerza a largo plazo de la deriva genética. [42]

Historia

En el siglo XIX, algunos científicos como Jean-Baptiste Lamarck (1744-1829) y Ray Lankester (1847-1929) creían que la naturaleza tenía un esfuerzo innato por volverse más compleja con la evolución. Esta creencia puede reflejar las ideas entonces vigentes de Hegel (1770-1831) y de Herbert Spencer (1820-1903), que preveían que el universo evolucionaría gradualmente hacia un estado superior y más perfecto.

Este punto de vista consideraba la evolución de los parásitos desde organismos independientes hasta una especie parásita como " involución " o "degeneración" y contraria a la naturaleza. Los teóricos sociales a veces han interpretado este enfoque metafóricamente para denunciar a ciertas categorías de personas como "parásitos degenerados". Los científicos posteriores consideraron la devolución biológica como una tontería; más bien, los linajes se vuelven más simples o más complicados según las formas que tuvieran una ventaja selectiva. [43]

En un libro de 1964, The Emergence of Biological Organization, Quastler fue pionero en una teoría de la emergencia, desarrollando un modelo de una serie de emergencias desde sistemas protobiológicos hasta procariotas sin la necesidad de invocar eventos inverosímiles de muy baja probabilidad. [44]

La evolución del orden, manifestada como complejidad biológica, en los sistemas vivos y la generación de orden en ciertos sistemas no vivos fue propuesta en 1983 para obedecer a un principio fundamental común llamado "la dinámica darwiniana". [45] La dinámica darwiniana se formuló considerando primero cómo se genera el orden microscópico en sistemas no biológicos simples que están lejos del equilibrio termodinámico . Luego se amplió la consideración a moléculas de ARN cortas y replicantes que se suponía eran similares a las primeras formas de vida en el mundo del ARN . Se demostró que los procesos subyacentes de generación de orden en los sistemas no biológicos y en la replicación del ARN son básicamente similares. Este enfoque ayudó a aclarar la relación de la termodinámica con la evolución, así como el contenido empírico de la teoría de Darwin .

En 1985, Morowitz [46] señaló que la era moderna de la termodinámica irreversible iniciada por Lars Onsager en la década de 1930 mostraba que los sistemas invariablemente se ordenaban bajo un flujo de energía, indicando así que la existencia de vida no implica contradicción con las leyes de la física. .

Ver también

Referencias

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