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ATP citrato sintasa

La ATP citrato sintasa (también ATP citrato liasa (ACLY) ) es una enzima que en animales representa un paso importante en la biosíntesis de ácidos grasos . [2] Al convertir el citrato en acetil-CoA , la enzima vincula el metabolismo de los carbohidratos , que produce citrato como intermediario , con la biosíntesis de ácidos grasos , que consume acetil-CoA. [3] En las plantas, la ATP citrato liasa genera precursores citosólicos de acetil-CoA de miles de metabolitos especializados , incluidas ceras , esteroles y policétidos . [4]

Función

La ATP citrato liasa es la principal enzima responsable de la síntesis de acetil-CoA citosólica en muchos tejidos. La enzima es un tetrámero de subunidades aparentemente idénticas. En animales, el producto, acetil-CoA, se utiliza en varias vías biosintéticas importantes, incluidas la lipogénesis y la colesterogénesis . [5] Es activado por la insulina. [6]

En las plantas, la ATP citrato liasa genera acetil-CoA para metabolitos sintetizados citosólicamente; El acetil-CoA no se transporta a través de las membranas subcelulares de las plantas. Dichos metabolitos incluyen: ácidos grasos alargados (utilizados en aceites de semillas, fosfolípidos de membrana , restos ceramida de esfingolípidos , cutícula , cutina y suberina ); flavonoides ; ácido malónico ; fenólicos acetilados , alcaloides , isoprenoides , antocianinas y azúcares ; e isoprenoides derivados de mevalonato (p. ej., sesquiterpenos , esteroles, brasinoesteroides ); derivados de malonilo y acilo (d-aminoácidos, flavonoides malonilados, proteínas aciladas, preniladas y malonadas). [4] La biosíntesis de novo de ácidos grasos en plantas ocurre en plastidios ; por tanto, la ATP citrato liasa no es relevante para esta vía.

Reacción

La ATP citrato liasa es responsable de catalizar la conversión de citrato y coenzima A (CoA) en acetil-CoA y oxaloacetato , impulsada por la hidrólisis del ATP . [3] En presencia de ATP y CoA, la citrato liasa cataliza la escisión del citrato para producir acetil CoA, oxaloacetato , adenosín difosfato (ADP) y ortofosfato (P i ):

citrato + ATP + CoA → oxaloacetato + Acetil-CoA + ADP + P i

Esta enzima recibió anteriormente el número CE 4.1.3.8. [7]

Ubicación

La enzima es citosólica en plantas [4] y animales. [8] [9]

Estructura

La enzima se compone de dos subunidades en plantas verdes (incluidas Chlorophyceae , Marchantimorpha, Bryopsida , Pinaceae , monocotiledóneas y eudicotiledóneas ), especies de hongos , glaucofitos , Chlamydomonas y procariotas .

Las enzimas ACL animales son homoméricas; Probablemente se produjo una fusión de los genes ACLA y ACLB en las primeras etapas de la historia evolutiva de este reino. [4]

La ATP citrato liasa de mamíferos tiene un dominio de unión a citrato N-terminal que adopta un pliegue de Rossmann , seguido de un dominio de unión a CoA y un dominio de CoA-ligasa y finalmente un dominio de citrato sintasa C-terminal . La hendidura entre los dominios de unión de CoA y citrato sintasa forma el sitio activo de la enzima, donde se unen tanto el citrato como la acetil-coenzima A.

En 2010, se determinó una estructura de ATP citrato liasa humana truncada mediante difracción de rayos X con una resolución de 2,10 Å . [3] En 2019, se determinó mediante cristalografía de rayos X una estructura de longitud completa de ACLY humana en complejo con los sustratos coenzima A, citrato y Mg.ADP con una resolución de 3,2 Å. [1] Además, en 2019 se determinó mediante métodos crio-EM una estructura de longitud completa de ACLY en complejo con un inhibidor con una resolución de 3,7 Å. [10] Estructuras adicionales de ACLY-A/B heteromérico de la bacteria verde del azufre Chlorobium limicola y la arqueona Methanosaeta concilii muestran que la arquitectura de ACLY se conserva evolutivamente . [1] Las estructuras ACLY de longitud completa mostraron que la proteína tetramérica se oligomeriza a través de su dominio C-terminal. El dominio C-terminal no se había observado en las estructuras cristalinas truncadas determinadas previamente. La región C-terminal de ACLY se ensambla en un módulo tetramérico que es estructuralmente similar a la citril-CoA liasa (CCL) que se encuentra en bacterias de ramificación profunda. [1] [11] Este módulo CCL cataliza la escisión del intermedio citril-CoA en los productos acetil-CoA y oxaloacetato. En 2019, también se informaron estructuras crio-EM de ACLY humana, solas o unidas a sustratos o productos. [12] [13] ACLY forma un homotetrámero con un módulo rígido de homología de citrato sintasa (CSH), flanqueado por cuatro dominios flexibles de homología de acetil-CoA sintetasa (ASH); CoA está unida a la interfaz CSH-ASH en conformaciones productivas o improductivas mutuamente excluyentes. La estructura de un mutante catalítico de ACLY en presencia de sustratos de ATP, citrato y CoA revela un intermedio de CoA y fósforo-citrato en el dominio N-terminal. Las estructuras crio-EM de productos unidos a ACLY y sustratos unidos a ACLY también se determinaron a 3,0 Å y 3,1 Å. Se determinó una estructura EM del mutante E599Q en complejo con CoA y fosfocitrato intermedio con una resolución de 2,9 Å. La comparación entre estas estructuras de apo-ACLY y los ligandos unidos a ACLY demostró cambios conformacionales en el dominio ASH (dominio N-terminal) cuando se unen diferentes ligandos.

Farmacología

La acción de la enzima puede ser inhibida por el conjugado de coenzima A del ácido bempedoico , un compuesto que reduce el colesterol LDL en humanos. [14] El medicamento fue aprobado por la Administración de Alimentos y Medicamentos en febrero de 2020 para su uso en los Estados Unidos.

Referencias

  1. ^ abcd Verschueren KH, Blanchet C, Felix J, Dansercoer A, De Vos D, Bloch Y, et al. (Abril de 2019). "Estructura de la ATP citrato liasa y origen de la citrato sintasa en el ciclo de Krebs" (PDF) . Naturaleza . 568 (7753): 571–575. Código Bib :2019Natur.568..571V. doi :10.1038/s41586-019-1095-5. PMID  30944476. S2CID  92999924.
  2. ^ Elshourbagy NA, Near JC, Kmetz PJ, Wells TN, Groot PH, Saxty BA, et al. (Marzo de 1992). "Clonación y expresión de un ADNc de ATP-citrato liasa humana". Revista europea de bioquímica . 204 (2): 491–9. doi : 10.1111/j.1432-1033.1992.tb16659.x . PMID  1371749.
  3. ^ abc Sun T, Hayakawa K, Bateman KS, Fraser ME (agosto de 2010). "Identificación del sitio de unión de citrato de la ATP-citrato liasa humana mediante cristalografía de rayos X". La Revista de Química Biológica . 285 (35): 27418–28. doi : 10.1074/jbc.M109.078667 . PMC 2930740 . PMID  20558738. 
  4. ^ abcd Fatland BL, Ke J, Anderson MD, Mentzen WI, Cui LW, Allred CC y col. (octubre de 2002). "Caracterización molecular de una ATP-citrato liasa heteromérica que genera acetil-coenzima A citosólica en Arabidopsis". Fisiología de las plantas . 130 (2): 740–56. doi : 10.1104/págs.008110. PMC 166603 . PMID  12376641. 
  5. ^ "Entrez Gene: ATP citrato liasa".
  6. ^ Guay C, Madiraju SR, Aumais A, Joly E, Prentki M (diciembre de 2007). "Un papel de la ATP-citrato liasa, la enzima málica y el ciclo de piruvato/citrato en la secreción de insulina inducida por glucosa". La Revista de Química Biológica . 282 (49): 35657–65. doi : 10.1074/jbc.M707294200 . PMID  17928289.
  7. ^ ATP + Citrato + Liasa en los títulos de materias médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
  8. ^ Zaidi N, Swinnen JV, Smans K (2012). "ATP-citrato liasa: un actor clave en el metabolismo del cáncer". Investigación sobre el cáncer . 72 (15): 3709–3714. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-11-4112 . PMID  22787121.
  9. ^ Pietrocola F, Galluzzi L, Bravo-San Pedro JM, Madeo F, Kroemer G (2015). "Acetil coenzima A: un metabolito central y segundo mensajero". Metabolismo celular . 21 (6): 805–821. doi : 10.1016/j.cmet.2015.05.014 . PMID  26039447.
  10. ^ Wei J, Leit S, Kuai J, Therrien E, Rafi S, Harwood HJ y col. (Abril de 2019). "Un mecanismo alostérico para una potente inhibición de la ATP-citrato liasa humana". Naturaleza . 568 (7753): 566–570. Código Bib :2019Natur.568..566W. doi :10.1038/s41586-019-1094-6. PMID  30944472. S2CID  93000843.
  11. ^ Aoshima M, Ishii M, Igarashi Y (mayo de 2004). "Una nueva enzima, la citril-CoA liasa, que cataliza el segundo paso de la reacción de escisión del citrato en Hydrogenobacter thermophilus TK-6". Microbiología Molecular . 52 (3): 763–70. doi :10.1111/j.1365-2958.2004.04010.x. PMID  15101982. S2CID  32105039.
  12. ^ Wei X, Schultz K, Bazilevsky GA, Vogt A, Marmorstein R (enero de 2020). "Base molecular para la producción de acetil-CoA por ATP-citrato liasa". Naturaleza Biología estructural y molecular . 27 (1): 33–41. doi :10.1038/s41594-019-0351-6. PMC 8436250 . PMID  31873304. 
  13. ^ Wei X, Schultz K, Bazilevsky GA, Vogt A, Marmorstein R (mayo de 2020). "Corrección del autor: base molecular para la producción de acetil-CoA por la ATP-citrato liasa". Naturaleza Biología estructural y molecular . 27 (5): 511–513. doi : 10.1038/s41594-020-0421-9 . PMC 8439269 . PMID  32242119. 
  14. ^ Ray KK, Bays HE, Catapano AL, Lalwani ND, Bloedon LT, Sterling LR, et al. (Prueba CLEAR Harmony) (marzo de 2019). "Seguridad y eficacia del ácido bempedoico para reducir el colesterol LDL". El diario Nueva Inglaterra de medicina . 380 (11): 1022-1032. doi : 10.1056/NEJMoa1803917 . hdl : 10044/1/68213 . PMID  30865796.

Otras lecturas

enlaces externos

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de Estados Unidos , que se encuentra en el dominio público .