La Copa de la UEFA 1998-99 la ganó el Parma en la final contra el Marsella . Fue su segundo título en la competición.
Fue la última edición del antiguo formato de la Copa de la UEFA, antes de que la Recopa de Recopa se fusionara para incluir a los ganadores de la copa nacional y se agregara una ronda eliminatoria adicional. El nuevo formato se jugó por última vez en la temporada 2003-04 y luego fue reemplazado por un formato de fase de grupos en 2004-05.
Las etiquetas entre paréntesis muestran cómo cada equipo se clasificó para el lugar de su ronda inicial: [1]
Argeş Piteşti ganó 7-1 en el global.
El CSKA Sofía ganó 3-1 en el global.
Omonia ganó 8-6 en total.
El Shakhtar Donetsk ganó por 6-1 en el global.
El Estrella Roja de Belgrado ganó 11-0 en el global.
El Inter Bratislava ganó 4-0 en el global.
Polonia Varsovia ganó 5-1 en el global.
VPS ganó 4-2 en total.
Kilmarnock ganó 2-1 en el global.
Mura ganó 8-2 en total.
3-3 en total; El Zalgiris Vilnius ganó gracias a los goles a domicilio.
Hapoel Tel Aviv ganó 6-2 en el global.
Malmö ganó 7-0 en el global.
Germinal Ekeren ganó 4-1 en el global.
Los Rangers ganaron 7-3 en total.
Oţelul Galaţi ganó 4-1 en el global.
IFK Göteborg ganó 7-0 en el global.
Ferencváros ganó 14-1 en el global.
Anderlecht ganó 6-0 en el global.
Wisła Kraków ganó 7-0 en el global.
El Estrella Roja de Belgrado ganó 4-2 en el global.
El AEK Atenas ganó 6-4 en el global.
Servette ganó 5-3 en el global.
4–4 en total; Argeş Piteşti ganó gracias a los goles a domicilio.
El CSKA Sofía ganó 2-0 en el global.
2-2 en total; El Fenerbahçe ganó gracias a los goles a domicilio.
Silkeborg ganó 2-0 en el global.
Los Rangers ganaron 2-0 en el global.
Slavia Praga ganó 4-2 en el global.
Zúrich ganó 6-3 en el global.
Brann ganó 1-0 en el global.
Wisła Kraków ganó 7-2 en el global.
Vejle ganó 6-0 en el global.
1–1 en total; Strømsgodset ganó 4-2 en los penaltis.
3-3 en total; Anderlecht ganó por goles a domicilio.
3-3 en total; El Rapid de Viena ganó gracias a los goles a domicilio.
Grazer AK ganó 3-0 en el global.
El Dinamo de Moscú ganó 2-0 en el global.
Hajduk Split ganó 3-2 en el global.
Sigma Olomouc ganó 4-0 en el global.
Wisła Kraków ganó 5-0 en el global.
1–1 en total; El Slavia Praga ganó 5-4 en los penaltis.
Bolonia ganó 4-1 en el global.
Willem II ganó 6-0 en total.
2-2 en total; El CSKA Sofía ganó gracias a los goles a domicilio.
El Dinamo de Moscú ganó 5-4 en el global.
La Fiorentina ganó 2-1 en el global.
Aston Villa ganó 6-2 en el global.
Grazer AK ganó 3-1 en el global.
3-3 en total; El Estrella Roja de Belgrado ganó 4-3 en los penaltis.
Werder Bremen ganó 4-2 en el global.
Zúrich ganó 7-2 en el global.
Marsella ganó 6-2 en el global.
La Real Sociedad ganó 5-2 en el global.
Stuttgart ganó 4-3 en el global.
Vitesse ganó 6-3 en el global.
Mónaco ganó 3-1 en el global.
Los saltamontes ganaron 2-0 en el global.
El Club Brujas ganó 7-2 en el global.
Burdeos ganó 3-2 en el global.
El Atlético de Madrid ganó 3-0 en el global.
Parma ganó 3-2 en el global.
El Celtic ganó 4-2 en el global.
La Roma ganó 3-0 en el global.
El Liverpool ganó 8-0 en el global.
El Bayer Leverkusen ganó 2-1 en el global.
Lyon ganó 3-2 en el global.
El Celta de Vigo ganó 8-0 en el global.
El Real Betis ganó 5-1 en el global.
Valencia ganó 7-3 en el global.
1–1 en total; El Leeds United ganó 4-1 en los penaltis.
Los Rangers ganaron 5-3 en total.
Bolonia ganó 4-1 en el global.
Burdeos ganó 3-1 en el global.
Parma ganó 3-2 en el global.
El Club Brujas ganó 4-3 en el global.
El AS Mónaco ganó 7-3 en el global.
La Real Sociedad ganó 6-2 en el global.
Zúrich ganó 5-3 en total.
Lyon ganó 5-3 en el global.
El partido fue suspendido en el descanso después de que el cuarto árbitro, Philippe Flament de Bélgica, sufriera una lesión en la rodilla y hematomas por un petardo arrojado al terreno de juego por los aficionados en las gradas. En el momento del incidente, la Fiorentina lideraba 2-1 esa noche y 4-1 en el global. Cuatro días después, en una reunión de emergencia de la UEFA, la Fiorentina fue expulsada de la Copa de la UEFA y el partido se registró como una victoria del Grasshopper por 0-3. La UEFA también consideró la futura expulsión de la Fiorentina de la competición europea, pero finalmente la descartó debido a circunstancias atenuantes , específicamente que el partido, como parte de un castigo anterior, no se jugó en el estadio local de la Fiorentina sino en Salerno y evidencia creíble de que el petardo fue probablemente lanzado por fanáticos del club local Salernitana que guardan rencor luego de un reciente partido de la Serie A entre los dos clubes. [2]
Grasshopper ganó 3-2 en el global.
El Celta de Vigo ganó por 3-2 en el global.
Marsella ganó 4-3 en el global.
La Roma ganó 1-0 en el global.
El Atlético de Madrid ganó 5-2 en el global.
2-2 en total; El Liverpool ganó por goles a domicilio.
El Real Betis ganó 4-1 en el global.
Los Rangers ganaron 3-2 en el global.
Parma ganó 4-2 en el global.
Bolonia ganó 4-2 en el global.
Lyon ganó 5-3 en el global.
3-3 en total; Burdeos ganó por goles a domicilio.
La Roma ganó 3-2 en el global.
El Celta de Vigo ganó 4-1 en el global.
Marsella ganó 3-2 en el global.
El Atlético de Madrid ganó 5-3 en el global.
Parma ganó 7-2 en el global.
Bolonia ganó 3-2 en el global.
El Atlético de Madrid ganó 4-2 en el global.
Marsella ganó 2-1 en el global.
1–1 en total; Marsella ganó por goles a domicilio.
Parma ganó 5-2 en el global.
