Químico británico
Antony John Williams es un químico británico y experto en los campos de la espectroscopia de resonancia magnética nuclear (RMN) y la quimioinformática en la Agencia de Protección Ambiental de los Estados Unidos . [2] [3] Es el fundador del sitio web ChemSpider que fue comprado por la Royal Society of Chemistry en mayo de 2009. Es un bloguero científico [4] y un autor. [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11]
Vida temprana y educación
Antony Williams nació en St Asaph , Gales , en junio de 1964, hijo de Ernest Edward Williams, propietario de una empresa de construcción, y Eirlys Elizabeth Williams. Tiene una hermana mayor, Rae. Creció en un pequeño pueblo cerca de Caerwys .
Williams asistió a la escuela primaria en Holywell y Nannerch hasta 1975. Desde los once años, asistió a la escuela Alun , donde recibió niveles A en matemáticas , geografía y química .
Williams obtuvo su Licenciatura en Ciencias en Química en la Universidad de Liverpool en 1985, escribiendo una disertación de pregrado sobre "Estudios espectroscópicos de sistemas relacionados con la vitamina E ", donde aplicó tanto la resonancia paramagnética electrónica (EPR) como la espectroscopia de resonancia magnética nuclear (NMR) al estudio de moléculas similares en estructura a la vitamina E.
Williams obtuvo su doctorado en química, financiado por Royal Dutch Shell , de Royal Holloway, Universidad de Londres en 1988 y escribió una tesis titulada "Estudios de RMN de alta presión y relajación de sistemas de cadenas alquílicas". [12] Ganó la Medalla Bourne de la Universidad de Londres por este trabajo y desarrolló una teoría unificadora para modelar datos de relajación de RMN para examinar los movimientos moleculares de las cadenas alquílicas. [13] También utilizó el desplazamiento químico de RMN de cobalto-59 para el hexacianuro de cobalto (III) como sonda de temperatura y presión. [14] Durante su doctorado desarrolló un interés en las computadoras personales y escribió programas de software para ajustar los datos de relajación de RMN.
Williams continuó su trabajo en espectroscopia en el Consejo Nacional de Investigación (Canadá) utilizando espectroscopia EPR para realizar estudios de monocristales de compuestos organometálicos.
Carrera
En 1991, Williams se incorporó a la Universidad de Ottawa como director de instalaciones de RMN. Continuó con sus intereses personales en RMN multinuclear para realizar experimentos de RMN 2D que examinaban el intercambio de selenio en sistemas de halógeno mixto. [15] También realizó estudios de RMN de silicio-29 y telurio-125 .
En 1992, Williams dejó Canadá para ir a Rochester, Nueva York, para trabajar en la Eastman Kodak Company como su líder en tecnología de RMN. En Kodak, utilizó su experiencia previa en el estudio de sistemas relacionados con cadenas de alquilo para estudiar micelas . [16] Participó en la adopción temprana de la cromatografía líquida - RMN en la empresa y en el desarrollo de un laboratorio de acceso abierto para que los químicos utilizaran instrumentación analítica robotizada para generar datos. En Kodak, formó parte de un equipo de tres miembros que desarrolló un sistema de gestión de información de laboratorio (LIMS) basado en la web llamado WIMS, [17] el sistema de gestión de información basado en la web y fue el primer sistema LIMS basado en la web del mundo para gestionar estructuras químicas y datos espectrales. Se le concedieron dos patentes mientras estaba en Kodak, [18] [19]
En 1997 comenzó a trabajar para una empresa emergente canadiense, Advanced Chemistry Development (ACD/Labs) como su gerente de producto senior. Era responsable de gestionar todos los productos de espectroscopia , dibujo de estructuras y nomenclatura IUPAC , [20] [21] . Mientras estaba en ese puesto, el software de gestión de datos analíticos se amplió para incluir soporte para espectrometría de masas , espectroscopia infrarroja , espectroscopia UV-Vis , cromatografía y otras formas de ciencias analíticas. Sus intereses de investigación en ese momento incluyen el desarrollo de algoritmos para la predicción de RMN ( [22] y [23] ) y, específicamente, el desarrollo de enfoques de software para la elucidación de estructuras asistida por computadora , los llamados sistemas CASE. [24] [25] [26] [27] [28] [29] Las herramientas CASE se han utilizado para el propósito de la revisión de la estructura, mediante la cual se ha demostrado que los algoritmos superan la interpretación humana de los datos espectrales. [30]
Mientras estuvo en ACD/Labs, Williams estuvo involucrado en una serie de innovaciones de la industria [ cita requerida ], incluyendo
- producir un diccionario químico en una Palm Computer y una Pocket PC, [31]
- trabajando con Gary E. Martin y otros colegas para desarrollar nuevas técnicas de procesamiento de RMN utilizando enfoques basados en la covarianza , [32] [33] [34] [35]
- la introducción de enfoques basados en lógica difusa para la elucidación de estructuras asistida por computadora y 4) Enfoques para la verificación automatizada de estructuras. [36]
Mientras estaba en la empresa, inició un proyecto de pasatiempo para vincular bases de datos de química en la web. Este proyecto se llamó ChemSpider . ChemSpider se anunció formalmente en la reunión de la ACS de Chicago en marzo de 2007 con una base de datos que contenía más de 10 millones de compuestos provenientes de PubChem . En 2007, cuando dejó ACD/Labs, era el Director Científico. Se convirtió en un consultor independiente que trabaja con varias empresas de software en el dominio de la quimioinformática, como SimBioSys , y con organizaciones de investigación para apoyar sus esfuerzos en quimioinformática. En paralelo, continuó desarrollando la plataforma ChemSpider con un pequeño grupo de personas con ideas afines interesadas en el desarrollo de sistemas basados en la web para servir a los químicos [37] [38] El sitio es una comunidad de colaboración colectiva para la química con químicos que depositan sus colecciones de estructuras, datos espectrales y propiedades moleculares. Williams se centra en educar a la comunidad sobre los problemas de calidad de los datos asociados con las bases de datos de química de Internet. [39] [40]
En mayo de 2009, la Royal Society of Chemistry anunció que había adquirido ChemSpider. [41] Williams se unió a RSC como vicepresidente de desarrollo estratégico para ChemSpider.
En mayo de 2015 se unió a la Agencia de Protección Ambiental de los Estados Unidos para trabajar en el desarrollo de sitios web que brinden acceso público a los datos de la EPA [42] y herramientas para espectrometría de masas . [43]
Williams ha contribuido al mundo de la "Química móvil" [44] al contribuir al desarrollo de ChemMobi, una aplicación para iPhone para acceder a millones de compuestos químicos y datos asociados.
Williams es un defensor de Open Notebook Science y es juez del Open Notebook Science Challenge . Trabajó con Jean-Claude Bradley para ofrecer un juego basado en la web para enseñar la interpretación de datos espectrales utilizando datos de espectroscopia de colaboración colectiva depositados en ChemSpider . [45]
Promoción de la ciencia abierta
Williams presentó una revista de acceso abierto , ChemSpider Journal of Chemistry, y el equipo de desarrollo proporcionó una nueva tecnología de marcado en línea (ChemMANTIS – Markup And Nomenclature Transformation Integrated System) para permitir el marcado colaborativo de términos relacionados con la química vinculados, cuando sea posible, a la base de datos ChemSpider. Williams es juez del Open Notebook Science Challenge . Promueve el uso de datos abiertos , en particular datos espectrales, publica en revistas de acceso abierto y es un defensor de Open Notebook Science . [46] Williams es un defensor de la liberación de datos preclínicos de la industria farmacéutica en Internet. [47] [48] [49] Williams ha trabajado en estrecha colaboración con Sean Ekins para defender la liberación de datos farmacéuticos precompetitivos a la comunidad. También ha participado en el análisis y revisión de datos farmacéuticos abiertos publicados a la comunidad. [50] [51] [52]
Williams, colaborador de Wikipedia desde hace mucho tiempo, ha cuestionado abiertamente los requisitos de notabilidad de la propia Wikipedia, comparando a estrellas porno con científicos. [53] [54]
Premios y honores
Williams fue el ganador del premio Jim Gray e-Science en 2012 [55] y del premio al Orador Distinguido del Año de la Sociedad Química Estadounidense de Carolina del Norte en 2016. [56]
Referencias
- ^ Williams, AJ; Harland, L.; Groth, P.; Pettifer, S .; Chichester, C.; Willighagen, EL; Evelo, CT; Blomberg, N.; Ecker, G .; Goble, C .; Mons, B. (2012). "Open PHACTS: interoperabilidad semántica para el descubrimiento de fármacos". Drug Discovery Today . 17 (21–22): 1188–1198. doi : 10.1016/j.drudis.2012.05.016 . PMID 22683805.
- ^ Publicaciones de Antony John Williams indexadas por Google Scholar
- ^ Personal. "2014-BIT-Brochure" (PDF) . 2014 Bio-IT World Expo . Cambridge Healthtech Institute. págs. 3 (col. 2) . Consultado el 15 de junio de 2016.
Antony Williams, Ph.D., vicepresidente de Desarrollo Estratégico; director de Quimioinformática de la Royal Society of Chemistry (RSC).
- ^ Sitio web de ChemConnector
- ^ Interpretación práctica de espectros de RMN de P-31 y verificación de estructura asistida por computadora, Louis Quin y Antony Williams, ISBN 978-0-9735913-0-9
- ^ Tecnologías computacionales colaborativas para la investigación biomédica, Sean Ekins, Maggie Hupcey y Antony Williams, ISBN 978-0-470-63803-3
- ^ Publicaciones de Antony John Williams de Europa PubMed Central
- ^ Antony Williams en LinkedIn.com
- ^ Perfil de Williams en Mendeley
- ^ Blog de Antony Williams ChemConnector Archivado el 28 de enero de 2011 en Wayback Machine.
- ^ Publicaciones de Antony John Williams indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (se requiere suscripción)
- ^ Williams, Antony John (1988). Estudios de RMN de alta presión y relajación de sistemas de cadenas alquílicas (tesis doctoral). Universidad de Liverpool.(se requiere suscripción)
- ^ Bratt, PJ; Gillies, DG; Sutcliffe, LH; Williams, AJ (1990). "Estudios de relajación de RMN de movimientos internos: una comparación entre micelas y sistemas relacionados". The Journal of Physical Chemistry . 94 (7): 2727. doi :10.1021/j100370a001.
- ^ Gillies, DG; Sutcliffe, LH; Williams, AJ (2002). "Investigación de alta presión y temperatura variable de la espectroscopia de RMN de cobalto-59 de K3\Co(CN)6] acuoso". Resonancia magnética en química . 40 : 57–64. doi :10.1002/mrc.955. S2CID 98518973.
- ^ Milne, J.; Williams, AJ (1992). "Procesos de intercambio en diselenio y dihaluros de selenio-azufre, Se2X2 y SeSX2 (X = Br, Cl). Un estudio de selenio-77 2D-EXSY". Química Inorgánica . 31 (22): 4534. doi :10.1021/ic00048a018.
- ^ Antalek, B.; Williams, AJ; García, E.; Texter, J. (1994). "Análisis de RMN de transiciones de estructura interfacial que acompañan la transición del umbral de transferencia de electrones en microemulsiones inversas". Langmuir . 10 (12): 4459. doi :10.1021/la00024a014.
- ^ Brown, D.; Williams, A.; McLaughlin, D. (1997). "Sistema de gestión de información basado en la Web". TrAC Trends in Analytical Chemistry . 16 (7): 370. doi :10.1016/S0165-9936(97)00046-0.
- ^ Emulsión fotográfica con una velocidad mejorada. Patente de EE.UU. 6.040.129
- ^ Proceso para la fabricación de dihidropirimidinas, patente de EE.UU. 5.576.432
- ^ Williams, A.; Yerin, A. (1999). "La necesidad de herramientas de software de denominación sistemática para el intercambio de información química". Moléculas . 4 (9): 255. doi : 10.3390/40900255 .
- ^ Williams, A.; Yerin, A. (2008). "Identificación y conversión automatizadas de nombres químicos en información que permite búsquedas de estructuras". Chemical Information Mining. pág. 21. doi :10.1201/9781420076509.pt2. ISBN 978-1-4200-7649-3.
- ^ Williams, A. (2000). "Avances recientes en predicción de RMN y software de elucidación automatizada de estructuras". Current Opinion in Drug Discovery & Development . 3 (3): 298–305. PMID 19649862.
- ^ Blinov, KA; Smurnyy, YD; Elyashberg, ME; Churanova, TS; Kvasha, M.; Steinbeck, C.; Lefebvre, BA; Williams, AJ (2008). "Validación del rendimiento de la predicción de RMN de 13C basada en redes neuronales utilizando una fuente de datos disponible públicamente". Journal of Chemical Information and Modeling . 48 (3): 550–555. doi :10.1021/ci700363r. PMID 18293952.
- ^ Elyashberg, ME; Blinov, KA; Molodtsov, SG; Williams, AJ; Martin, GE (2007). "Generación de estructura difusa: una nueva herramienta eficiente para la elucidación de estructuras asistida por computadora (CASE)". Revista de información y modelado químico . 47 (3): 1053–1066. doi :10.1021/ci600528g. PMID 17385849.
- ^ Elyashberg, ME; Williams, AJ; Martin, GE (2008). "Herramientas de verificación y elucidación de estructuras asistidas por computadora en la elucidación de estructuras basada en RMN". Progreso en espectroscopia de resonancia magnética nuclear . 53 (1–2): 1–104. doi :10.1016/j.pnmrs.2007.04.003.
- ^ Smurnyy, YD; Elyashberg, ME; Blinov, KA; Lefebvre, BA; Martin, GE; Williams, AJ (2005). "Determinación asistida por computadora de la estereoquímica relativa y modelos 3D de moléculas orgánicas complejas a partir de espectros de RMN 2D". Tetrahedron . 61 (42): 9980. doi :10.1016/j.tet.2005.08.022.
- ^ Martin, GE; Hadden, CE; Russell, DJ; Kaluzny, BD; Guido, JE; Duholke, WK; Stiemsma, BA; Thamann, TJ; Crouch, RC; Blinov, K.; Elyashberg, M.; Martirosian, ER; Molodtsov, SG; Williams, AJ; Schiff, PL (2002). "Identificación de degradantes de un alcaloide complejo utilizando tecnología de criosonda de RMN y ACD/elucidador de estructura". Journal of Heterocyclic Chemistry . 39 (6): 1241. doi :10.1002/jhet.5570390619.
- ^ Blinov, K.; Elyashberg, M.; Martirosian, ER; Molodtsov, SG; Williams, AJ; Tackie, AN; Sharaf, MMH; Schiff, PL; Crouch, RC; Martin, GE; Hadden, CE; Guido, JE; Mills, KA (2003). "Quindolinocryptotackieine: La elucidación de una nueva estructura de alcaloide de indoloquinolina mediante el uso de elucidación de estructura asistida por computadora y RMN 2D". Resonancia magnética en química . 41 (8): 577. doi : 10.1002/mrc.1227 .
- ^ Elyashberg, ME; Blinov, KA; Martirosian, ER; Molodtsov, SG; Williams, AJ; Martin, GE (2003). "Elucidación automatizada de la estructura: los beneficios de una relación simbiótica entre el espectroscopista y el sistema experto". Journal of Heterocyclic Chemistry . 40 (6): 1017. doi :10.1002/jhet.5570400610.
- ^ Elyashberg, M.; Williams, AJ; Blinov, K. (2010). "Revisiones estructurales de productos naturales mediante sistemas de elucidación de estructura asistida por computadora (CASE)". Natural Product Reports . 27 (9): 1296–1328. doi :10.1039/C002332a. PMID 20480119. S2CID 37849167.
- ^ "Bases de datos de química en la palma de la mano y en el bolsillo". Archivado desde el original el 18 de diciembre de 2010. Consultado el 17 de febrero de 2011 .
- ^ Blinov, KA; Larin, NI; Kvasha, MP; Moser, A.; Williams, AJ; Martin, GE (2005). "Análisis y eliminación de artefactos en espectros de RMN de covarianza indirecta mediante procesamiento asimétrico". Resonancia magnética en química . 43 (12): 999–1007. doi :10.1002/mrc.1674. PMID 16144032. S2CID 26808858.
- ^ Blinov, KA; Williams, AJ; Hilton, BD; Irish, PA; Martin, GE (2007). "El uso de métodos de RMN de covarianza indirecta asimétrica para obtener el equivalente de datos HSQC-NOESY". Resonancia magnética en química . 45 (7): 544–546. doi :10.1002/mrc.1998. PMID 17437315. S2CID 46106410.
- ^ Martin, GE; Irish, PA; Hilton, BD; Blinov, KA; Williams, AJ (2007). "Utilización del procesamiento de covarianza indirecta asimétrica para definir redes de conectividad 15N-13C". Resonancia magnética en química . 45 (8): 624–627. doi :10.1002/mrc.2029. PMID 17563910. S2CID 34281811.
- ^ Martin, GE; Hilton, BD; Irish, PA; Blinov, KA; Williams, AJ (2007). "Aplicación de métodos de RMN de covarianza indirecta asimétrica al cálculo de los espectros de correlación 13C↔15N HSQC-IMPEACH y 13C↔15N HMBC-IMPEACH". Resonancia magnética en química . 45 (10): 883–888. doi :10.1002/mrc.2064. PMID 17729230. S2CID 41359162.
- ^ Golotvin, SS; Vodopianov, E.; Pol, R.; Lefebvre, BA; Williams, AJ; Rutkowske, RD; Spitzer, TD (2007). "Verificación de estructura automatizada basada en una combinación de espectros de RMN 1D1H y HSQC 2D1H-13C". Resonancia magnética en química . 45 (10): 803–813. doi :10.1002/mrc.2034. PMID 17694570. S2CID 25476827.
- ^ Pence, HE; Williams, A. (2010). "ChemSpider: un recurso de información química en línea". Revista de educación química . 87 (11): 1123. Bibcode :2010JChEd..87.1123P. doi :10.1021/ed100697w.
- ^ Bases de datos de compuestos públicos: cómo ChemSpider cambió las reglas al hacer que las moléculas en la web sean gratuitas, Antony J. Williams en Collaborative Computational Technologies for the Life Sciences, editado por Sean Ekins, Maggie AZ Hupcey y Antony J. Williams, enviado para su publicación a Wiley
- ^ Williams, A. (2008). "Una perspectiva de bases de datos de química de acceso público/abierto". Drug Discovery Today . 13 (11–12): 495–501. doi :10.1016/j.drudis.2008.03.017. PMID 18549975.
- ^ Williams, AJ; Ekins, S. (2011). "Una alerta de calidad y un llamado a mejorar la conservación de las bases de datos públicas de química". Drug Discovery Today . 16 (17–18): 747–750. doi :10.1016/j.drudis.2011.07.007. PMID 21871970.
- ^ "cumplir su objetivo estratégico de difundir conocimientos a la comunidad química y promover las ciencias químicas"
- ^ Perfil personal de la EPA
- ^ McEachran, AD; Sobus, JR; Williams, AJ (2017). "Identificación de incógnitas conocidas mediante el panel de química CompTox de la EPA de EE. UU." Química analítica y bioanalítica . 409 (7): 1729–1735. doi :10.1007/s00216-016-0139-z. PMID 27987027. S2CID 31754962.
- ^ AJ Williams, Química móvil: la química en tus manos y en tu rostro, Chemistry World, mayo de 2010
- ^ Bradley, JC; Lancashire, RJ; Lang, ASD; Williams, AJ (2009). "El juego espectral: aprovechamiento de datos abiertos y crowdsourcing para la educación". Journal of Cheminformatics . 1 (1): 9. doi : 10.1186/1758-2946-1-9 . PMC 3225864 . PMID 20298527.
- ^ Bradley, JC; Owens, K.; Williams, A. (2008). "Química colaborativa y ciencia de cuadernos abiertos". Nature Precedings . doi : 10.1038/npre.2008.1505.1 .
- ^ Ekins, S.; Williams, AJ (2010). "Datos preclínicos ADME/Tox precompetitivos: póngalos a disposición en la web para facilitar la creación de modelos computacionales y ayudar al desarrollo de fármacos". Lab on a Chip . 10 (1): 13–22. doi :10.1039/b917760b. PMID 20024044.
- ^ AJ Williams, V. Tkachenko, C. Lipinski, A. Tropsha y S. Ekins, Recursos gratuitos en línea que facilitan la colaboración colectiva, Drug Discovery World Winter 2009/10, 33-39
- ^ Ekins, S.; Williams, AJ (2010). "Cuando las compañías farmacéuticas publican grandes conjuntos de datos: ¿una abundancia de riquezas o un oro para tontos?". Drug Discovery Today . 15 (19–20): 812–815. doi :10.1016/j.drudis.2010.08.010. PMID 20732447.
- ^ Ekins, S.; Williams, AJ (2010). "Cuando las compañías farmacéuticas publican grandes conjuntos de datos: ¿una abundancia de riquezas o un oro para tontos?". Drug Discovery Today . 15 (19–20): 812–815. doi :10.1016/j.drudis.2010.08.010. PMID 20732447.
- ^ Ekins, S.; Williams, AJ (2010). "Metaanálisis de patrones de propiedades moleculares y filtrado de conjuntos de datos públicos de "éxitos" y fármacos antipalúdicos". MedChemComm . 1 (5): 325. doi :10.1039/C0MD00129E.
- ^ Williams, AJ; Harland, L.; Groth, P.; Pettifer, S .; Chichester, C.; Willighagen, EL; Evelo, CT; Blomberg, N.; Ecker, G .; Goble, C .; Mons, B. (2012). "Open PHACTS: interoperabilidad semántica para el descubrimiento de fármacos". Drug Discovery Today . 17 (21–22): 1188–1198. doi : 10.1016/j.drudis.2012.05.016 . PMID 22683805.
- ^ "» ¿Por qué las estrellas porno son más famosas que los científicos en Wikipedia? Blog de ChemConnector".
- ^ "¿Por qué las estrellas porno son más conocidas que los científicos en Wikipedia? | Wikimedian in Residence". Archivado desde el original el 28 de marzo de 2012. Consultado el 8 de diciembre de 2011 .
- ^ Premio Jim Gray de ciencias electrónicas, Antony Williams
- ^ Premio al Orador Destacado del Año de la NC ACS, Antony Williams
Enlaces externos
- Sitio web oficial
- Antony John Williams en Twitter