stringtranslate.com

Variante preocupante del SARS-CoV-2

SARS-CoV-2, el virus que causa el COVID-19

El término variante preocupante ( VOC ) para el SARS-CoV-2 , que causa el COVID-19 , es una categoría utilizada para las variantes del virus en las que las mutaciones en su dominio de unión al receptor de la proteína de pico (RBD) aumentan sustancialmente la afinidad de unión (p. ej., N501Y ) en el complejo RBD-hACE2 (datos genéticos), al mismo tiempo que se relaciona con una rápida propagación en poblaciones humanas (datos epidemiológicos). [1]

Antes de ser asignada a esta categoría, una variante emergente puede haber sido etiquetada como variante de interés ( VOI ), [2] o, en algunos países, como variante bajo investigación ( VUI ). [3] Durante o después de una evaluación más completa como variante de interés, la variante generalmente se asigna a un linaje en el sistema de nomenclatura Pango [4] y a clados en los sistemas Nextstrain [5] y GISAID [6] .

Durante la pandemia de COVID-19 , se ha observado que el virus SARS-CoV-2 muta, y ciertas combinaciones de mutaciones puntuales específicas resultan ser más preocupantes que otras. [7] Esto se debió principalmente a razones de transmisibilidad y virulencia , y también con respecto a la posible aparición de mutaciones de escape .

A partir de mayo de 2024, la Organización Mundial de la Salud designa las variantes Delta y Omicron como variantes circulantes preocupantes .

Criterios

Varias organizaciones de salud nacionales e internacionales (por ejemplo, los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) (EE. UU.), Public Health England (PHE) y el Consorcio COVID-19 Genomics UK para el Reino Unido, y la Red Canadiense de Genómica COVID (CanCOGeN)) utilizan algunos o todos los siguientes criterios para evaluar variantes : [8] [9]

Las variantes que parezcan cumplir uno o más de estos criterios pueden denominarse "variantes de interés" o "variantes bajo investigación" ("VUI") en espera de la verificación y validación de estas propiedades. Una vez validadas, las organizaciones de seguimiento, como los CDC, pueden cambiar el nombre de las variantes de interés/VUI a "variantes preocupantes". [3] [7] [10] Una categoría relacionada es "variante de altas consecuencias", utilizada por los CDC si hay evidencia clara de que la efectividad de las medidas de prevención o intervención para una variante particular se reduce sustancialmente. [11]

Clasificaciones por país

Organización Mundial de la Salud

La OMS mantiene una lista de variantes de preocupación mundial. [2] El 26 de noviembre de 2021, la OMS añadió una quinta variante preocupante, la variante Omicron , anteriormente conocida como B.1.1.529. [12] Omicron se suma a las variantes Alfa , Beta , Gamma y Delta . [ cita necesaria ] A partir de marzo de 2023, todas estas se consideran variantes preocupantes "que circulan previamente" y clasificaron los sublinajes de Omicron de forma independiente como variantes bajo monitoreo (VUM), VOI o VOC. [13]

África

El NICD de Sudáfrica mantiene una lista de variantes e instalaciones de prueba a nivel local en colaboración con KRISP . [14] [15]

Europa

En noviembre de 2021, el Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades declaró cuatro variantes como "variantes preocupantes": Beta, Gamma, Delta y B.1.1.529 (denominada "Omicron" después de que se actualizó la referencia); Mu, Lambda y AY.4.2 fueron nombradas Variantes de Interés (VOI), mientras que había 9 "Variantes bajo seguimiento". 25 variantes fueron descritas como "reducidas". [dieciséis]

Reino Unido

En noviembre de 2021, el Reino Unido tiene quince variantes en su "lista de vigilancia", 4 con estado "VOC" y 11 clasificadas como "VUI". Los designados como 'COV' fueron Alfa, Beta, Gamma y Delta. A principios de diciembre de 2021, se añadió Omicron a los VOC. Entre las variantes bajo investigación se encuentra 'VUI-21OCT-01/ AY 4.2' . [17]

América del norte

Canadá (a través de Health-infobase.canada.ca) [18] y Estados Unidos (a través de CDC ) [19] también mantienen listas de variantes preocupantes. A principios de diciembre, Canadá estaba monitoreando cinco variantes preocupantes: Alpha, Beta, Gamma, Delta y Omicron, mientras que Estados Unidos estaba monitoreando dos: Delta y Omicron. [20]

Referencias

  1. ^ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (mayo de 2021). "Firmas de mutación y acoplamiento in silico de nuevas variantes preocupantes del SARS-CoV-2". Microorganismos . 9 (5): 926. doi : 10.3390/microorganismos9050926 . PMC  8146828 . PMID  33925854.
  2. ^ ab "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2". www.who.int . Consultado el 28 de noviembre de 2021 .
  3. ^ ab "Variantes: distribución de datos de casos". GOBIERNO DEL REINO UNIDO . 28 de enero de 2021. En "Diferencias entre una variante preocupante y una variante bajo investigación" . Consultado el 19 de febrero de 2021 . Las variantes del SARS-CoV-2, si se considera que tienen propiedades epidemiológicas, inmunológicas o patógenas preocupantes, se plantean para una investigación formal. En este punto, se les designa Variante bajo investigación (VUI) con un año, mes y número. Después de una evaluación de riesgos con el comité de expertos correspondiente, pueden ser designados Variante de Preocupación (VOC)
  4. ^ Rambaut, A.; Holmes, CE; O'Toole, Á.; et al. (2020). "Una propuesta de nomenclatura dinámica para los linajes del SARS-CoV-2 para ayudar a la epidemiología genómica". Microbiología de la naturaleza . 5 (11): 1403-1407. doi : 10.1038/s41564-020-0770-5 . PMC 7610519 . PMID  32669681. S2CID  220544096. 
  5. ^ Bedford, Trevor; Hodcroft, Emma B; Neher, Richard A (6 de enero de 2021). "Estrategia actualizada de denominación del clado Nextstrain SARS-CoV-2". nextstrain.org/blog . Consultado el 19 de enero de 2021 .
  6. ^ "árbol de clados (de 'Nomenclatura de clados y linajes')". www.gisaid.org . 4 de julio de 2020 . Consultado el 7 de enero de 2021 .
  7. ^ ab Griffiths, Emma; Tanner, Jennifer; Knox, Natalie; Hsiao, Will; Van Domselaar, Gary (15 de enero de 2021). "Recomendaciones provisionales de CanCOGeN para nombrar, identificar y notificar variantes preocupantes del SARS-CoV-2" (PDF) . CanCOGeN (nccid.ca) . Consultado el 25 de febrero de 2021 .
  8. ^ Lucey, Daniel R. (2 de febrero de 2021). "Megavariante" de COVID y ocho criterios para una plantilla para evaluar todas las variantes. La ciencia habla: noticias de identificación global . Consultado el 5 de junio de 2022 .
  9. ^ CDC (11 de febrero de 2020). "Variantes emergentes del SARS-CoV-2". Centros de Control y Prevención de Enfermedades . Consultado el 4 de enero de 2021 . Dominio publicoEste artículo incorpora texto de esta fuente, que se encuentra en el dominio público .
  10. ^ "Investigación de variantes preocupantes del SARS-CoV-2 en Inglaterra; informe técnico 6 (ver sección: Nomenclatura de variantes en el Reino Unido, P.3)" (PDF) . activos.publishing.service.gov.uk . 13 de febrero de 2021 . Consultado el 27 de febrero de 2021 .
  11. ^ CDC (11 de febrero de 2020). "Casos, Datos y Vigilancia". Centros de Control y Prevención de Enfermedades . Consultado el 16 de marzo de 2021 .
  12. ^ "Clasificación de Omicron (B.1.1.529): variante preocupante del SARS-CoV-2". Organización Mundial de la Salud . Consultado el 28 de noviembre de 2021 .
  13. ^ "Declaración sobre la actualización de las definiciones de trabajo y el sistema de seguimiento de la OMS para las variantes preocupantes y de interés del SARS-CoV-2". www.who.int . Consultado el 19 de abril de 2024 .
  14. ^ "Nueva variante de COVID-19 detectada en Sudáfrica". NICD . 25 de noviembre de 2021 . Consultado el 29 de noviembre de 2021 .
  15. ^ "Plataforma de secuenciación e innovación en investigación de Kwazulu-Natal". www.krisp.org.za . Consultado el 29 de noviembre de 2021 .
  16. ^ "Variantes preocupantes del SARS-CoV-2". www.ecdc.europa.eu . 26 de noviembre de 2021 . Consultado el 27 de noviembre de 2021 .
  17. ^ "Variantes preocupantes o en investigación: datos hasta el 24 de noviembre de 2021". www.gov.uk. ​26 de noviembre de 2021 . Consultado el 27 de noviembre de 2021 .
  18. ^ Canadá, Agencia de Salud Pública de (19 de abril de 2020). "Actualización diaria de epidemiología de COVID-19: resumen". aem . Consultado el 13 de mayo de 2021 .
  19. ^ "Clasificaciones y definiciones de variantes del SARS-CoV-2". Centros de Control y Prevención de Enfermedades . 11 de febrero de 2020 . Consultado el 30 de abril de 2021 .
  20. ^ "Enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19)". Centros de Control y Prevención de Enfermedades . 11 de febrero de 2020 . Consultado el 7 de diciembre de 2021 .