Escribió muchos trabajos sobre pensamiento político y literatura; destacan en especial sus dos volúmenes de History of English thought in the eighteenth century (1876) y The English utilitarians (3 vols.
Fue durante unos años presidente del Club Alpino que había cofundado en 1857 e igualmente editor del Alpine Journal entre 1868 y 1871.
Su obra más famosa, el Diccionario de la biografía nacional,[3] fue concebido en 1880 por George Smith, editor de John Ruskin, las hermanas Brontë, Anthony Trollope y de muchos otros novelistas principales británicos del siglo XIX.
[4] Mientras que Stephen era elegante en su escritura, pero a veces poco metódico e indulgente con sus biografiados, Lee era un maniático del orden, la precisión y el método, y un trabajador fanático sin llegar a ser pedante.
Como filósofo, escribió una ética evolucionista (Science of Ethics, 1882) y se extendió al campo de la Historia de las ideas con una Historia del pensamiento inglés en el Ochocientos, 1876 y Utilitarismo inglés, 1900.