Haplogrupo de ADN del cromosoma Y humano
El haplogrupo R2a , o haplogrupo R-M124 , es un haplogrupo del cromosoma Y caracterizado por los marcadores genéticos M124, P249, P267, L266, y se encuentra principalmente en el sur de Asia , así como en Asia central , el Cáucaso , Asia occidental y el norte de África / MENA .
Historial del término
El haplogrupo R2a también se conoce como haplogrupo R-M124. [2] La primera referencia al haplogrupo recientemente definido, "R-M124", fue el 25 de agosto de 2010. [4]
Antes de la publicación del árbol filogenético del cromosoma Y de 2005, el haplogrupo R-M124 se conocía como haplogrupo P1 y se pensaba que era un clado hermano del haplogrupo R en lugar de derivar de él. [5]
El haplogrupo R2 se observa con mayor frecuencia en Asia, especialmente en el subcontinente indio y Asia Central . [5] También se informa con frecuencias notables en el Cáucaso .
Orígenes
Según Sengupta et al. (2006),
La incertidumbre neutraliza las conclusiones previas de que la intrusión de los HG R1a1 y R2 [ahora R-M124] del noroeste en las tribus meridionales de habla dravidiana es atribuible a un único evento reciente. Más bien, estos HG contienen una considerable complejidad demográfica, como lo implica su alta diversidad de haplotipos. En concreto, podrían haber llegado en realidad al sur de la India desde una región de origen del sudoeste asiático varias veces, con algunos episodios considerablemente antes que otros.
Subclados
Paragrupo R-M124*
Paragrupo es un término utilizado en genética de poblaciones para describir linajes dentro de un haplogrupo que no están definidos por ningún marcador único adicional . Por lo general, se representan con un asterisco ( * ) colocado después del haplogrupo principal.
Los cromosomas Y que son positivos para los SNP M124, P249, P267 y L266 y negativos para los SNP L295, L263 y L1069 se clasifican como pertenecientes al paragrupo R-M124*. Hasta el momento, se encuentra en Irak.
Haplogrupo R-L295
El haplogrupo R-L295 es un haplogrupo del cromosoma Y caracterizado por el marcador genético L295. Se encuentra en el sur de Asia , Anatolia , la península Arábiga , Europa y Asia central hasta el momento.
Haplogrupo R-L263
El haplogrupo R-L263 es un haplogrupo del cromosoma Y caracterizado por el marcador genético L263. Se encuentra en Asia Menor griega y Armenia hasta el momento. [6]
Haplogrupo R-L1069
El haplogrupo R-L1069 es un haplogrupo del cromosoma Y caracterizado por el marcador genético L1069. Se encuentra en Kuwait hasta el momento. [6]
Distribución
El R-M124 se observa con mayor frecuencia en Asia, especialmente en el subcontinente indio y en Asia Central [5]. También se informa en frecuencias notables en el Cáucaso .
Histórico
Se observaron muestras antiguas del haplogrupo R2a en los restos de humanos del Neolítico, Calcolítico y de la Edad del Bronce en Irán y Turan ; y de la Edad del Hierro en el sur de Asia . El R2a también se recuperó de restos excavados en los sitios del sur de Asia de Saidu Sharif y Butkara de un período posterior. [7]
Aia del Sur
El haplogrupo R-M124, junto con los haplogrupos H , L , R1a1 y J2 , constituye la mayoría de la población masculina del sur de Asia. La frecuencia es de alrededor del 10-15% en India y Sri Lanka y del 7-8% en Pakistán . Su propagación dentro del sur de Asia es muy extensa, desde Baluchistán en el oeste hasta Bengala en el este; Hunza en el norte hasta Sri Lanka en el sur.
India
Entre los grupos regionales, se encuentra entre los bengalíes occidentales (23%), los hindúes de Nueva Delhi (20%), los punjabis (5%) y los gujaratis (3%). [8]
Entre los grupos tribales, los karmalis de Bengala Occidental mostraron el porcentaje más alto con un 100% (16/16) [9] seguidos por los lodhas (43%) [10] al este, mientras que los bhil de Gujarat en el oeste estaban en un 18%, [11] los tharus del norte lo mostraron en un 17%, [12] los chenchu y los pallan del sur estaban en un 20% y un 14% respectivamente. [9] [13] Entre los grupos de castas, los porcentajes altos los muestran los kshatriyas de Jaunpur (87%), kamma chaudhary (73%), bihar yadav (50%), khandayat (46%) y kallar (44%). [9]
También es significativamente alto en muchos grupos brahmanes , incluidos los brahmanes punjabi (25%), los brahmanes bengalíes (22%), los brahmanes konkanastha (20%), los chaturvedis (32%), los bhargavas (32%), los pandits de Cachemira (14%) y los brahmanes lingayat (30%). [11] [14] [12] [9]
Los musulmanes del norte de la India tienen una frecuencia del 19% ( sunitas ) y del 13% ( chiítas ), [14] mientras que los musulmanes Dawoodi Bohra en el estado occidental de Gujarat tienen una frecuencia del 16% y los musulmanes Mappila del sur de la India tienen una frecuencia del 5%. [15]
Pakistán
El haplogrupo R2 en las regiones del norte de Pakistán se encuentra entre los pueblos burusho (14%), pastunes (10%) y hazaras (4%). [16] [13]
En las regiones del sur, se encuentra entre los baluchis (12%), los brahuis (12%) y los sindhis (5%). [13]
Afganistán
El haplogrupo R2-M124 se presenta en una proporción considerablemente mayor en las regiones del norte de Afganistán (11,4%). [17] Aunque el porcentaje real sigue siendo objeto de debate, se sabe que el haplogrupo se encuentra en niveles elevados en la población pamiri (la cifra oscila entre el 6 y el 17% según el grupo). Un estudio sobre los nuristaníes muestra una frecuencia del 20% de R2 (1/5), aunque con un tamaño de muestra pequeño. [18]
Sri Lanka
Según una investigación de 2003, el 38% de los cingaleses de Sri Lanka eran R2 positivos. [8]
Asia central
En las tribus kazajas varía del 1% al 12%, sin embargo se encuentra en un porcentaje mayor, alrededor del 25% entre la tribu Tore / tribu descendiente de Genghis Khan. [19]
En Asia Central, Tayikistán muestra el haplogrupo R-M124 en un 6%, mientras que los otros estados con la etiqueta "-stan" varían alrededor del 2%. Bartangis de Tayikistán tiene una alta frecuencia de R-M124 en un 17%, Ishkashimi en un 8%, Khojant en un 9% y Dusambé en un 6%.
Específicamente, el haplogrupo R-M124 se ha encontrado en aproximadamente el 7,5% (4/53) de los emigrantes iraníes recientes que viven en Samarcanda , [20] el 7,1% (7/99) de los pamiríes , [20] el 6,8% (3/44) de los karakalpaks , [20] el 5,1% (4/78) de los tayikos , [20] el 5% (2/40) de los dunganos en Kirguistán , [20] el 3,3% (1/30) de los turcomanos , [20] el 2,2% (8/366) de los uzbekos , [20] y el 1,9% (1/54) de los kazajos . [20]
Asia oriental
Un estudio genético de 2011 encontró R-M124 en el 6,7% de los chinos han del oeste de Henan , el 3,4% de los chinos han de Gansu y entre el 2,1% y el 4,2% de los uigures de Xinjiang . [21]
En un artículo de 2014, se detectó R-M124 en el 0,9 % (1/110) de muestras de chinos Han de China . La muestra pertenecía a un individuo de la provincia de Jilin . [22]
Asia occidental y África del Norte
La frecuencia del haplogrupo R-M124 del 6,1% (6/114) se encontró entre los kurdos en general [23], mientras que en un estudio que se realizó con 25 muestras de kurdos kurmanji de Georgia , se observó R-M124 en un 44% (11/25) [24].
En el Cáucaso se observó una alta frecuencia en los armenios de Sason en un 17% (18/104) [25] mientras que se observó en un 1% en los armenios de Van. Se ha encontrado R2 en chechenos en un 16%. [26] Se ha encontrado R-M124 en aproximadamente el 8% (2/24) de una muestra de osetios de Alagir . [27]
En el Cáucaso, alrededor del 16% de los judíos de las montañas , el 8% de los balkarios , [28] el 6% de los calmucos , [29] el 3% de los azerbaiyanos , [26] el 2,6 % de los kumiks , [30] el 2,4% de los ávaros , [30] el 2% de los armenios , [26] y entre el 1% y el 6% de los georgianos [26] [28] [31] pertenecen al haplogrupo R-M124. Aproximadamente el 1% de los turcos [32] y entre el 1% y el 3% de los iraníes [33] también pertenecen a este haplogrupo.
En Irán, el R-M124 sigue una distribución similar a la del R1a1 , con porcentajes más elevados en el sureste del país. Se ha encontrado en frecuencias del 9,1 % en Isfahán , del 6,9 % en Hormozgan y del 4,2 % en Mazandarán. [34]
En los proyectos R2-M124-WTY y R-Arabia Y-DNA, [6] [35] el haplogrupo R-M124 ha aparecido en los siguientes países árabes : Kuwait (3 grupos), Emiratos Árabes Unidos (1 grupo), República Árabe Siria (1 grupo) y Túnez (1 grupo).
Así, el haplogrupo R-M124 se ha observado entre los árabes en frecuencias bajas en 11 países/territorios ( Egipto , Jordania , Kuwait , Líbano , Palestina , Qatar , Siria , Túnez , Emiratos Árabes Unidos y Yemen ) de los 22 países /territorios árabes hasta el momento. En el Reino de Arabia Saudita hasta el momento se ha identificado una familia con el haplogrupo R2A (R-M124) de su genoma paterno o cromosoma Y, actualizado el 5 de enero de 2018.
Posición en el árbol ISOGG y SNP relacionados
El haplogrupo R-M124 es un subgrupo del haplogrupo R-M479 (M479):
- R-M479 (M479)
- R-M124 (M124, P249, P267, L266)
- R-L295 (L295)
- R-L263 (L263)
- R-L1069 (L1069)
Predicción con haplotipos
El haplotipo se puede utilizar para predecir el haplogrupo. Las probabilidades de que una persona forme parte de este haplogrupo son más altas si DYS391 = 10, DYS392 = 10 y DYS426 = 12.
Véase también
Subclados del ADN-Y R-M207
Árbol de la estructura principal del ADN-Y
Notas
- ^ ab YFull Haplogroup YTree v5.05 el 30 de julio de 2017
- ^ ab ISOGG (2010), "Haplogrupo R del ADN-Y y sus subclados - 2010".
- ^ Borrador del árbol filogenético de FTDNA, "Borrador del árbol filogenético de FTDNA Archivado el 10 de julio de 2011 en Wayback Machine ."
- ^ Myres et al. (2010), "Un importante haplogrupo R1b del cromosoma Y, efecto fundador de la era del Holoceno en Europa central y occidental - 2010".
- ^ abc Manoukian, Jean-Grégoire (2006), "Una síntesis del haplogrupo R2 - 2006".
- ^ abc Proyecto R2-M124-WTY (Caminata por la Y), "Proyecto R2-M124-WTY (Caminata por la Y)".
- ^ Narasimhan, Vagheesh M.; Patterson, Nick.; Moorjani, Priya; Lazaridis, Iosif; Mark, Lipson; Mallick, Swapan; Rohland, Nadin; Bernardos, Rebecca; Kim, Alexander M. (31 de marzo de 2018). "La formación genómica del sur y centro de Asia". bioRxiv : 292581. doi : 10.1101/292581 . hdl : 21.11116/0000-0001-E7B3-0 .
- ^ ab Kivisild, T. ; et al. (2003), "La herencia genética de los primeros colonos persiste tanto en las poblaciones tribales como en las de castas de la India", The American Journal of Human Genetics , 72 (2): 313–32, doi :10.1086/346068, PMC 379225 , PMID 12536373
- ^ abcd Sahoo, S.; et al. (2006), "Una prehistoria de los cromosomas Y de la India: evaluación de escenarios de difusión demica", Actas de la Academia Nacional de Ciencias , 103 (4): 843–8, Bibcode :2006PNAS..103..843S, doi : 10.1073/pnas.0507714103 , PMC 1347984 , PMID 16415161
- ^ Kumar, Vikrant; et al. (2007). "La evidencia del cromosoma Y sugiere una herencia paterna común de las poblaciones austroasiáticas". BMC Evolutionary Biology . 7 : 47. doi : 10.1186/1471-2148-7-47 . PMC 1851701 . PMID 17389048.
- ^ ab Sharma, Swarkar; et al. (2009). "El origen indio del haplogrupo paterno R1a1* corrobora el origen autóctono de los brahmanes y el sistema de castas". Journal of Human Genetics . 54 (1): 47–55. doi : 10.1038/jhg.2008.2 . PMID 19158816.
- ^ ab Tripathy, Vikal; Nirmala, A.; Reddy, B. Mohan (2008), "Tendencias en los estudios antropológicos moleculares en la India" (PDF) , Revista internacional de genética humana , 8 (1–2): 1–20, doi :10.1080/09723757.2008.11886015, S2CID 12763485
- ^ abc Sengupta, Sanghamitra; et al. (2006). "Polaridad y temporalidad de distribuciones de cromosoma Y de alta resolución en India identifican expansiones tanto indígenas como exógenas y revelan una influencia genética menor de los pastores de Asia central". The American Journal of Human Genetics . 78 (2): 202–21. doi :10.1086/499411. PMC 1380230 . PMID 16400607.
- ^ ab Zhao, Zhongming; et al. (2009). "Presencia de tres linajes paternos diferentes entre los indios del norte: un estudio de 560 cromosomas Y". Anales de biología humana . 36 (1): 46–59. doi :10.1080/03014460802558522. PMC 2755252 . PMID 19058044.
- ^ Eaaswarkhanth, Muthukrishnan; et al. (2009). "Rastros de linajes subsaharianos y de Oriente Medio en poblaciones musulmanas indias". Revista Europea de Genética Humana . 18 (3): 354–63. doi :10.1038/ejhg.2009.168. PMC 2859343 . PMID 19809480.
- ^ Firasat, Sadaf; et al. (2006). "Evidencia del cromosoma Y de una contribución griega limitada a la población Pathan de Pakistán". Revista Europea de Genética Humana . 15 (1): 121–6. doi :10.1038/sj.ejhg.5201726. PMC 2588664 . PMID 17047675.
- ^ Lacau, Harlette (18 de abril de 2012). "Afganistán desde la perspectiva del cromosoma Y". Revista Europea de Genética Humana . 20 (10): 1063–1070. doi :10.1038/ejhg.2012.59. PMC 3449065 . PMID 22510847.
- ^ Haber, Marc (28 de marzo de 2012). "Los grupos étnicos de Afganistán comparten una herencia cromosómica Y estructurada por eventos históricos". PLOS ONE . 7 (3): e34288. Bibcode :2012PLoSO...734288H. doi : 10.1371/journal.pone.0034288 . PMC 3314501 . PMID 22470552.
- ^ Jabagin Maksat Kizatovich. ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ О БЩЕЙ ГЕНЕТИКИ им. Н.И. ВАВИЛОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК (PDF) (Doctor). Academia de Ciencias de Rusia.
- ^ abcdefgh Wells, R. Spencer; Yuldasheva, Nadira; Ruzibakiev, Ruslan; Underhill, Peter A.; Evseeva, Irina; Blue-Smith, Jason; Jin, Li; Su, Bing; Pitchappan, Ramasamy; Shanmugalakshmi, Sadagopal; Balakrishnan, Karuppiah; Lee, Marcos; Pearson, Nathaniel M.; Zerjal, Tatiana; Webster, Mateo T.; Zholoshvili, Irakli; Jamarjashvili, Elena; Gambarov, Spartak; Nikbin, Behrouz; Dostiev, Ashur; Aknazarov, Ogonazar; Zalloua, Pierre; Tsoy, Igor; Kitaev, Mijaíl; Mirrakhimov, Mirsaid; Chariev, Ashir; Bodmer, Walter F. (28 de agosto de 2001). "El corazón de Eurasia: una perspectiva continental sobre la diversidad del cromosoma Y". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 98 (18): 10244–10249. Bibcode :2001PNAS...9810244W. doi : 10.1073/pnas.171305098 . PMC 56946 . Número de identificación personal 11526236.
- ^ Zhong H, Shi H, Qi XB, et al. (enero de 2011). "Una investigación ampliada del cromosoma Y sugiere migraciones postglaciales de humanos modernos hacia el este de Asia a través de la ruta del norte". Biología molecular y evolución . 28 (1): 717–27. doi : 10.1093/molbev/msq247 . PMID 20837606.
- ^ Yan, Shi; Wang, Chuan-Chao; Zheng, Hong-Xiang; Wang, Wei; Qin, Zhen-Dong; Wei, Lan-Hai; Wang, Yi; Pan, Xue-Dong; Fu, Wen-Qing; Él, Yun Gang; Xiong, Li-Jun; Jin, Wen-Fei; Li, Shi-Lin; An, Yu; Li, Hui; Jin, Li; Su, Bing (29 de agosto de 2014). "Los cromosomas Y del 40% de los chinos descienden de tres superabuelos neolíticos". MÁS UNO . 9 (8): e105691. arXiv : 1310.3897 . Código Bib : 2014PLoSO...9j5691Y. doi : 10.1371/journal.pone.0105691 . PMC 4149484 . Número de modelo: PMID25170956.
- ^ "Genética kurda - ADN de los kurdos del Kurdistán (Irak-Irán-Turquía)" www.khazaria.com . Consultado el 20 de diciembre de 2019 .
- ^ "[1]."
- ^ "[2]."
- ^ abcd Nasidze I, Sarkisian T, Kerimov A, Stoneking M (marzo de 2003). "Prueba de hipótesis de reemplazo del lenguaje en el Cáucaso: evidencia del cromosoma Y". Genética humana . 112 (3): 255–61. doi :10.1007/s00439-002-0874-4. PMID 12596050. S2CID 13232436.[3] Archivado el 10 de noviembre de 2007 en Wayback Machine
Manoukian (2006) - ^ I. Nasidze, D. Quinque, I. Dupanloup et al. , "Evidencia genética sobre los orígenes de los osetios del sur y del norte", Anales de genética humana (2004) 68, 588–599
- ^ ab Vincenza Battaglia, Simona Fornarino, Nadia Al-Zahery et al. , "Evidencia del cromosoma Y de la difusión cultural de la agricultura en el sudeste de Europa", European Journal of Human Genetics (2008), 1 – 11
- ^ Ivan Nasidze, Dominique Quinque, Isabelle Dupanloup, Richard Cordaux, Lyudmila Kokshunova y Mark Stoneking, "Evidencia genética de la ascendencia mongola de los kalmyks", American Journal of Physical Anthropology 126:000–000 (2005).
- ^ de Yunusbaev et al. (2006): 2/76 = 2,6 % R-M124 Kumyks, 1/42 = 2,4 % R-M124 Avars
- ^ Semino O, Passarino G, Oefner PJ, Lin AA, Arbuzova S, Beckman LE, De Benedictis G, Francalacci P, Kouvatsi A, Limborska S, Marcikiae M, Mika A, Mika B, Primorac D, Santachiara-Benerecetti AS, Cavalli-Sforza LL, Underhill PA (noviembre de 2000). "El legado genético del Homo sapiens sapiens paleolítico en los europeos actuales: una perspectiva del cromosoma Y" (PDF) . Science . 290 (5494): 1155–9. Bibcode :2000Sci...290.1155S. doi :10.1126/science.290.5494.1155. PMID 11073453. Archivado desde el original (PDF) el 25 de noviembre de 2003.
- ^ Cinnioğlu et al. (2003), "Excavación de estratos de haplotipos del cromosoma Y en Anatolia Archivado el 19 de junio de 2006 en Wayback Machine ."
- ^ Regueiro M, Cadenas AM, Gayden T, Underhill PA, Herrera RJ (2006). "Irán: nexo tricontinental para la migración impulsada por el cromosoma Y". Herencia humana . 61 (3): 132–43. doi :10.1159/000093774. PMID 16770078. S2CID 7017701.
- ^ "[4]."
- ^ Proyecto Y-ADN de R-Arabia, "Proyecto Y-ADN de R-Arabia".
- ^ Alshamali, Farida; Pereira, Luísa; Budowle, Bruce; Poloni, Estella S.; Currat, Mathias (2009). "Estructura de la población local en la península arábiga revelada por la diversidad de Y-STR". Herencia humana . 68 (1): 45–54. doi : 10.1159/000210448 . ISSN 0001-5652. PMID 19339785. S2CID 2751928.
- ^ ab Cadenas, Alicia M.; Zhivotovsky, Lev A.; Cavalli-Sforza, Luca L.; Underhill, Peter A.; Herrera, Rene J. (marzo de 2008). "La diversidad del cromosoma Y caracteriza al Golfo de Omán". Revista Europea de Genética Humana . 16 (3): 374–386. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . ISSN 1476-5438. PMID 17928816. S2CID 32386262.
- ^ Mohammad, T.; Xue, Y.; Evison, M.; Tyler-Smith, C. (noviembre de 2009). "Estructura genética de los beduinos nómadas de Kuwait". Heredity . 103 (5): 425–433. doi :10.1038/hdy.2009.72. ISSN 1365-2540. PMC 2869035 . PMID 19639002.
- ^ Flores, Carlos; Maca-Meyer, Nicole; Larruga, Jose M.; Cabrera, Vicente M.; Karadsheh, Naif; Gonzalez, Ana M. (septiembre de 2005). "Aislamientos en un corredor de migraciones: un análisis de alta resolución de la variación del cromosoma Y en Jordania". Journal of Human Genetics . 50 (9): 435–441. doi : 10.1007/s10038-005-0274-4 . ISSN 1435-232X. PMID 16142507. S2CID 6490283.
- ^ Zalloua, Pierre A.; Xue, Yali; Khalife, Jade; Makhoul, Nadine; Debiane, Labib; Platt, Daniel E.; Royyuru, Ajay K.; Herrera, Rene J.; Hernanz, David F. Soria; Blue-Smith, Jason; Wells, R. Spencer; Comas, David; Bertranpetit, Jaume; Tyler-Smith, Chris (11 de abril de 2008). "La diversidad del cromosoma Y en el Líbano está estructurada por eventos históricos recientes". Revista estadounidense de genética humana . 82 (4): 873–882. doi :10.1016/j.ajhg.2008.01.020. ISSN 0002-9297. PMC 2427286 . PMID 18374297.
- ^ Myres et al. (2010), "Un importante haplogrupo R1b del cromosoma Y, efecto fundador de la era del Holoceno en Europa central y occidental".
- ^ Luis et al. (2004), "El Levante versus el Cuerno de África: evidencia de corredores bidireccionales de migraciones humanas Archivado el 16 de febrero de 2012 en Wayback Machine ."
Referencias
- Manoukian, Jean-Grégoire (2006). "Una síntesis del haplogrupo R2" (PDF) (publicado el 1 de diciembre de 2006)..
- Sengupta S, Zhivotovsky LA, King R, Mehdi SQ, Edmonds CA, Chow CE, Lin AA, Mitra M, Sil SK, Ramesh A, Usha Rani MV, Thakur CM, Cavalli-Sforza LL, Majumder PP, Underhill PA (febrero de 2006). "La polaridad y la temporalidad de las distribuciones de alta resolución del cromosoma Y en la India identifican expansiones tanto indígenas como exógenas y revelan una influencia genética menor de los pastores de Asia central". American Journal of Human Genetics . 78 (2): 202–21. doi :10.1086/499411. PMC 1380230 . PMID 16400607.
- Zerjal T, Pandya A, Thangaraj K, Ling EY, Kearley J, Bertoneri S, Paracchini S, Singh L, Tyler-Smith C (marzo de 2007). "Información sobre el cromosoma Y en el impacto genético del sistema de castas en la India". Genética humana . 121 (1): 137–44. doi :10.1007/s00439-006-0282-2. PMC 2590678 . PMID 17075717.
Enlaces externos
- Propagación de R2
- El Proyecto Genealógico de ADN de la India
- Proyecto de ADN del haplogrupo del cromosoma Y R2
- Profundizando en el haplogrupo R2 (ADN-Y)
- Proyecto R2-M124-WTY (Paseo por la Y)
- Proyecto Y-ADN de R-Arabia
- Lista de frecuencias R2 Archivado el 11 de marzo de 2014 en Wayback Machine.