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Tim Hubbard

Timothy John Phillip Hubbard es profesor de bioinformática en el King's College de Londres , jefe de análisis genómico en Genomics England y profesor honorario en el Wellcome Trust Sanger Institute en Cambridge, Reino Unido. [2] [8] [9] [ 10] [11] [12] [13] A partir del 1 de marzo de 2024, Hubbard se convirtió en el director de la infraestructura de datos de ciencias biológicas de Europa ELIXIR . [14]

Educación

Hubbard se formó en la Universidad de Cambridge , donde obtuvo una licenciatura en Ciencias Naturales (Bioquímica) en 1985. Continuó realizando investigaciones en diseño de proteínas en el Departamento de Cristalografía del Birkbeck College de Londres, donde obtuvo un doctorado en 1988 [15] por una investigación supervisada por Tom Blundell .

Investigación y carrera

Los intereses de investigación de Hubbard son la bioinformática , la biología computacional y la informática genómica . [1] Durante su permanencia en WTSI, supervisó a varios estudiantes de doctorado exitosos hasta su finalización en estas áreas de investigación. [16] [17] [18] [19] [20] [21]

Tras una beca postdoctoral en el Instituto de Investigación de Ingeniería de Proteínas en Osaka en el marco del programa de formación científica de la UE en Japón (1989-90), regresó a Cambridge y se convirtió en miembro de Zeneca en el Centro de Ingeniería de Proteínas del Consejo de Investigación Médica (MRC) . En 1997 se incorporó al Instituto Sanger de Wellcome Trust para convertirse en director de Análisis del Genoma Humano . Tim fue director de Informática de 2007 a 2013, cuando fue destinado a tiempo parcial como asesor especializado del Servicio Nacional de Salud de Inglaterra , involucrado en la entrega de genómica para programas de salud. [22]

Hubbard fue nombrado profesor de Bioinformática en King's en octubre de 2013. [23] Su investigación ha sido publicada en importantes revistas científicas revisadas por pares , incluyendo Nature , [24] [25] [26] Journal of Molecular Biology , [3] [27] Nucleic Acids Research , [5] [6] Genome Biology , [4] Nature Methods , [28] Nature Reviews Cancer [29] y Bioinformatics . [30] Su investigación ha sido financiada por el Medical Research Council (MRC) y el Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC) . [31]

Referencias

  1. ^ Publicaciones de Tim Hubbard indexadas por Google Scholar
  2. ^ ab "Genomics England publica los resultados de su evaluación de anotaciones". Genomics England. 2014. Archivado desde el original el 12 de enero de 2015.
  3. ^ ab Murzin, AG; Brenner, S. ; Hubbard, T.; Chothia, C. (1995). "SCOP: Una base de datos de clasificación estructural de proteínas para la investigación de secuencias y estructuras" (PDF) . Journal of Molecular Biology . 247 (4): 536–540. doi :10.1016/S0022-2836(05)80134-2. PMID  7723011. Archivado desde el original (PDF) el 26 de abril de 2012.
  4. ^ ab Harrow, J; Denoeud, F; Franco, A; Reymond, A; Chen, CK; Chrast, J; Lagarde, J; Gilbert, JG; Piso, R; Swarbreck, D; Rossier, C; Ucla, C; Hubbard, T; Antonarakis, SE; Guigo, R (2006). "GENCODE: Generación de una anotación de referencia para ENCODE". Biología del genoma . 7 (Suplemento 1): S4.1–9. doi : 10.1186/gb-2006-7-s1-s4 . PMC 1810553 . PMID  16925838. 
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  6. ^ ab Farrell, CM; O'Leary, NA; Harte, RA; Loveland, JE; Wilming, LG; Wallin, C.; Diekhans, M.; Barrell, D.; Searle, SMJ; Aken, B.; Hiatt, SM; Frankish, A.; Suner, M. -M.; Rajput, B.; Steward, CA; Brown, GR; Bennett, R.; Murphy, M.; Wu, W.; Kay, MP; Hart, J.; Rajan, J.; Weber, J.; Snow, C.; Riddick, LD; Hunt, T.; Webb, D.; Thomas, M.; Tamez, P.; Rangwala, SH (2013). "Estado actual y nuevas características de la base de datos de secuencias codificantes de consenso". Nucleic Acids Research . 42 (Número de la base de datos): D865–D872. doi : 10.1093 / nar/gkt1059.PMC 3965069.PMID 24217909  . 
  7. ^ Moult, J; Hubbard, T; Fidelis, K; Pedersen, JT (1999). "Evaluación crítica de los métodos de predicción de la estructura de proteínas (CASP): Ronda III". Proteins . Suppl 3 (S3): 2–6. doi :10.1002/(sici)1097-0134(1999)37:3+<2::aid-prot2>3.3.co;2-u. PMID  10526346.
  8. ^ Tim Hubbard en Twitter
  9. ^ Hubbard, Tim J P. Publicaciones indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (se requiere suscripción)
  10. ^ Página de perfil del autor Tim JP Hubbard en la Biblioteca Digital ACM
  11. ^ Tim JP Hubbard en el servidor de bibliografía DBLP
  12. ^ Hopkin, Karen (1 de octubre de 2009). "Tim Hubbard: el gurú del genoma". The Scientist . Archivado desde el original el 4 de marzo de 2014.
  13. ^ Publicaciones de Tim Hubbard de Europa PubMed Central
  14. ^ "Tim Hubbard será el nuevo director de ELIXIR". 2023-12-01.
  15. ^ Hubbard, Tim (1988). El diseño, la expresión y la caracterización de una nueva proteína (tesis doctoral). Universidad de Londres. Archivado desde el original el 19 de mayo de 2015.
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  17. ^ Down, Thomas Alexander (2004). Localización computacional de promotores y sitios de inicio de la transcripción en genomas de mamíferos (tesis doctoral). Universidad de Cambridge.
  18. ^ Doğruel, Mutlu (2008). Identificación computacional basada en motivos de la localización subcelular de proteínas (tesis doctoral). Universidad de Cambridge. OCLC  890154619.
  19. ^ Mattison, Jenny (2009). Análisis de conjuntos de datos de mutaciones asociadas al cáncer en todo el genoma de ratones y humanos (tesis doctoral). Universidad de Cambridge. OCLC  890152898.
  20. ^ Piipari, Matias (2011). Inferencia y clasificación de motivos cis-reguladores eucariotas (tesis doctoral). Universidad de Cambridge.
  21. ^ Pocock, Matthew Richard (2004). Análisis computacional de genomas (tesis doctoral). Universidad de Cambridge. OCLC  890159072.
  22. ^ "Doctor honorario del Wellcome Trust Sanger Institute: Dr. Tim Hubbard". Archivado desde el original el 23 de marzo de 2015.
  23. ^ "Profesor Tim Hubbard, King's College de Londres". Archivado desde el original el 23 de febrero de 2014.
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  31. ^ "Subvenciones del gobierno del Reino Unido otorgadas a Tim Hubbard". Research Councils UK . Archivado desde el original el 9 de abril de 2015.