El E-6B reemplazó a los EC-135C de la Fuerza Aérea en la tarea "Looking Glass", proporcionando mando y control de las fuerzas nucleares estadounidenses en caso de que el control terrestre quedase inoperativo.La producción se mantuvo hasta 1991, por lo que el E-6 fue el último derivado nuevo del Boeing 707 en ser construido.[2] Como el avión E-3 Sentry de alerta temprana y control aerotransportado (AWACS), el E-6 es una adaptación del avión de pasajeros Boeing 707-320.[3] Se entregaron dieciséis unidades de 1988 a 1992.Esto incrementó sustancialmente el control del piloto y redujo los costes respecto al paquete anterior de aviónica adaptada.