Actualmente dirige al San Jose Earthquakes de la Major League Soccer.
El equipo se quedó con la MLS Cup tras derrotar a Los Angeles Galaxy en la final del torneo.
[4] En su primer año con el club fue bastante irregular, pero en 2009, avanzó a los playoffs y disputó la final por el título, en la cual perdió en los penales ante el Real Salt Lake.
En 2012 tuvo un mediocre primer semestre, pero meses después, logró clasificar a la postemporada y ganó nuevamente la MLS Cup.
En 2014 alcanzó su quinto campeonato de liga tras derrotar al New England Revolution en la final.
[6] Sin embargo, dimitió unos meses después, en octubre, tras no poder clasificarse para el Mundial de Rusia 2018.