Alcanzó el rango de mayor general del ejército británico durante la guerra Franco-india.

Sir William llegó a ser un hombre muy rico y su finca en el valle del Río Mohawk tenía 1.600km².

En ella construyó una mansión de piedra, a la que llamó Mount Johnson y que se convertiría en Fort Johnson al estallar la guerra Franco-india y rodearse de una muralla.

Johnson logró una convivencia pacífica y fue adoptado por los mohawk, que lo nombraron jefe honorario en 1742.

Cuando John Prideaux, el comandante de la campaña, murió en combate fue Johnson quien tomó el control y ganó el fuerte.

Tras la guerra, el Rey George le premió con más tierras al norte del Mohawk.

En 1762 Fundó la ciudad de Johnstown, donde creó una escuela para niños ingleses e indios.

La mayor parte de sus tierras eran cuidadas por esclavos, aunque trajo a muchos irlandeses como terratenientes.

Su entierro fue multitudinario y los miembros de las Seis Naciones le dedicaron un rito aparte del cristiano.