A las 6:20 GMT, 1:20 (hora local), el primer oficial pasa por los procedimientos de control para su viaje.

Esa noche el capitán Raulf Nour El Din y el primer oficial Gamil El Batouty son los pilotos de refuerzo.

[3]​[4]​ Mientras el capitán estaba en el baño, Gamil El Batouty, único tripulante en cabina, desconecta el piloto automático y lanza el morro del avión hacia abajo, inclinándose.

Apaga los motores y el avión empieza a descender en caída libre en dirección al océano mientras hay una fuerza G 0 de absoluta ingravidez dentro del avión, el primer oficial, manteniendo una absoluta tranquilidad y sangre fría, sólo repite en varias ocasiones claramente la frase: "I rely on God" (Confío de Dios).

[9]​[10]​ Al amanecer, el buque escuela United States Merchant Marine Academy T/V Kings Pointer encontró una mancha de petróleo y algunos pequeños restos.

El FDR y el CVR fueron recuperados en pocos días por el sumergible Deep Drone III de la Marina estadounidense.

Así pues, la teoría oficial expuesta por el FBI afirma que el primer oficial a bordo del avión había cortado la alimentación de los motores para suicidarse porque días antes le habían comunicado que ese sería su último vuelo; y el caso fue cerrado.

Muchos conocidos del primer oficial afirman que la teoría del suicidio les parece imposible ya que éste era una persona muy alegre, no sufría problemas familiares ni económicos ni sufría de depresión.

No obstante, el programa concluyó que Al-Batouti estrelló el avión por motivos personales; había sido severamente reprendido por su supervisor por acoso sexual después de supuestamente «exponerse a chicas adolescentes y hacerle proposiciones a los huéspedes del hotel» y el supervisor estaba, de hecho, a bordo del avión cuando fue derribado.

Más bien, simplemente establece que el accidente fue el resultado directo de acciones realizadas por el copiloto por razones «no determinadas».