La población que es hoy Villa Ocampo tuvo su origen durante las épocas de la conquista española del norte de la Nueva España, la región que son hoy los estados de Durango y Chihuahua fue conocida como la Nueva Vizcaya y su conquista y sometimiento por parte del gobierno colonial fue complicada debido a lo aguerrido de los grupos indígenas que les hicieron frente, en esta zona en particular por tepehuanes y tarahumaras.

En la de 1618 murió en San Miguel el principal líder tepehuano, llamado Oñate.

resolviéndose finalmente que el límite se estableciera en la división de aguas del río Florido, quedado por tanto San Miguel y su comarcarca en Durango.

Inicialmente formó parte del partido de Indé hasta a finales del siglo XIX quedó establecida como cabecera municipal con el nombre de Villa Ocampo.

En sus cercanías en el cauce del río Florido se encuentra la presa Federalismo Mexicano, más conocida como presa San Gabriel, que suministra el líquido necesario para la actividad agrícola en la región.