En biología, la variación de fase es un método para lidiar con entornos que varían rápidamente sin requerir una mutación aleatoria.La variación de fase contribuye a la virulencia al generar heterogeneidad.Salmonella utiliza esta técnica para cambiar entre diferentes tipos de proteína flagelina.[2] Esto se hace cambiando la disposición espacial del promotor o los elementos reguladores.La recombinasa FimE tiene la capacidad de invertir solo el elemento y cambiar la expresión de encendido a apagado, mientras que FimB puede mediar la inversión en ambas direcciones.[5] P. atlantica contiene un locus eps que codifica polisacárido extracelular y la expresión ENCENDIDO o APAGADO de este locus está controlada por la presencia o ausencia de IS492.Las versiones silenciosas de este gen, PilS, pueden utilizar la recombinación homóloga para combinarse con partes del gen PilE y así crear un fenotipo diferente.Cuando Dam metila los sitios GATC, inhibe la unión del OxyR, lo que permite la transcripción de Ag43.La secuencia promotora puede moverse entre estas regiones conservadas y permitir la expresión de un gen diferente.[1] Este mecanismo independiente de RecA puede ocurrir durante la replicación del ADN o la reparación del ADN y puede estar en la cadena principal o retrasada.Una forma posible es si las repeticiones están ubicadas en la región promotora en el sitio de unión de la ARN polimerasa, -10 y -35 cadena arriba del gen o genes.Las regiones promotoras superpuestas tienen repeticiones del dinucleótido TA en las secuencias -10 y -35.[3][9] La segunda forma en que el SSM induce la regulación transcripcional es cambiando las secuencias de repetición cortas ubicadas fuera del promotor.
Error de emparejamiento de hebra deslizada de variación de fase