La primera referencia escrita corresponde al año 959, en un documento del Monasterio de Sahagún.

La familia de los Osorio forman parte de la historia del pueblo, como lo demuestra tanto la existencia del palacio y su escudo, como su actuación para promover el convento.

Se describe a Valdunquillo de la siguiente manera, entre los años 1845 y 1850, realizado por Pascual Madoz en el "Diccionario geográfico-estadístico-histórico de España y sus posesiones de ultramar": "Villa con ayuntamiento propio en la provincia, audiencia territorial y cuartel general de Valladolid, partido judicial de Villalón, diócesis de León: Situada en un corto valle rodeado de cerros, con clima templado y sano; tiene 200 casas de mediana construcción; un palacio toscano, propiedad del duque de Wervich y Alba; la casa del mayorazgo fundado por el comisario Pérez, y otras 4 más, todas 5 del mismo orden arquitectónico que el palacio; escuela primaria frecuentada por 90 alumnos de ambos sexos, a cargo de un maestro dotado con 1.500 reales; 2 fuentes de buenas aguas; 1 bonita alameda en el centro de la población; 2 iglesias parroquiales (Santa María y San Pedro) servidas cada una por su respectivo cura y sacristán; una ermita (Santa Cruz) y un convento que fue de mercedarios.

Caminos: los que dirigen a los pueblos limítofes, Benavente y Villalón,en mediano estado.

Correo: se recibe y despacha en Benavente.