La universidad fue fundada en 1220 por el cardenal Conrad y confirmada por el papa Nicolás IV en una bula en 1289.
La universidad fue suprimida durante la Revolución francesa y restablecida en 1896.
Actualmente, Montpellier cuenta con tres universidades herederas de la pionera y con diversas escuelas politécnicas superiores, públicas y privadas.
Artículo principal: Universidad Montpellier I Está localizada en el centro de la Región Languedoc-Rosellón y fue fundada en 1289.
Participan también más de 15 000 estudiantes en 7 unidades: Universidad Montpellier III también llamada Universidad Paul-Valéry[2], con campus universitarios en Montpellier y en Beziers cuenta con cerca de 16.000 estudiantes (en 2008).